1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtaatgtcacttataccatcaattgcagtattcttggttgttttatgttttgaatgactttactctccctaatggtctgctaatgtttgtccatatattcagGTAATGAGTGTTAAAGCTCTTGGTACATCCTTAAAGTTGACGTTTGAGGGGACAAATCAGTTGGTATATCCAGAGACTTGGTTCTTTGTGCTTATAGTGG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os05g43790.1 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CAAATGTGTTGATCTACACTGCCATTTGCTCTTTGATGGGTTCTCTTTCG GTAATGAGTGTTAAAGCTCTTGGTACATCCTTAAAGTTGACGTTCGAGGGGEST: gi|33662767|gb|CF293734.1|CF293734
genomic: CAAATGTGTTGATCTACACTGCCATTTGCTCTTTGATGGGTTCTCTTTCGgtaatgtcac ... atatattcagGTAATGAGTGTTAAAGCTCTTGGTACATCCTTAAAGTTGACGTTTGAGGGG
EST: CAAATGTGTTGATCTACACTGCCATTTGCTCTTTGATGGGTTCTCTTTCG GTAATGAGTGTTAAAGCTCTTGGTACATCCTTAAAGTTGACGTTTGAGGGG
genomic: CAAATGTGTTGATCTACACTGCCATTTGCTCTTTGATGGGTTCTCTTTCGgtaatgtcac ... atatattcagGTAATGAGTGTTAAAGCTCTTGGTACATCCTTAAAGTTGACGTTTGAGGGG
ttttgaatgactttactctccctaatggtctgctaatgtttgtccatatattcagGTAATGAGTGTTAAAGCTCTTGGTACATCCTTAAAGTTGACGTTTGAGGGGACAAATCAGTTGGTATATCCAGAGACTTGGTTCTTTGTGCTTATAGTGG
tgctaat putative branch site (score: 2)
atatattca TA-rich tract