1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtaaccatgtcatctgaatccatttccccttcagatatatcacatgtactctcttcctaaatagacttggttctggtatgacagCTTGTGTTGAGCACTGGAAATGGAGTAAACGGTTTCACCCTTGATCCTTCCCTTGGGGAGTTCATTCTGACTCATCCAAACATCAAG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os05g36270.2 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GAACAGACATGCTTGCTGCTGGCTACTGCATGTACGGGAGTTCATGCACG CTTGTGTTGAGCACTGGAAATGGAGTAAACGGTTTCACCCTTGATCCTTCCEST: gi|29663073|gb|CB659348.1|CB659348
genomic: GAACAGACATGCTTGCTGCTGGCTACTGCATGTACGGGAGTTCATGCACGgtaaccatgt ... ggtatgacagCTTGTGTTGAGCACTGGAAATGGAGTAAACGGTTTCACCCTTGATCCTTCC
EST: GAACAGACATGCTTGCTGCTGGCTACTGCATGTACGGGAGTTCATGCACG CTTGTGTTGAGCACTGGAAATGGAGTAAACGGTTTCACCCTTGATCCTTCCEST: gi|29644325|gb|CB649332.1|CB649332
genomic: GAACAGACATGCTTGCTGCTGGCTACTGCATGTACGGGAGTTCATGCACGgtaaccatgt ... ggtatgacagCTTGTGTTGAGCACTGGAAATGGAGTAAACGGTTTCACCCTTGATCCTTCC
EST: GAACAGACATGCTTGCTGCTGGCTACTGCATGTACGGGAGTTCATGCACG CTTGTGTTGAGCACTGGAAATGGAGTAAACGGTTTCACCCTTGATCCTTCCEST: gi|33684972|gb|CF313211.1|CF313211
genomic: GAACAGACATGCTTGCTGCTGGCTACTGCATGTACGGGAGTTCATGCACGgtaaccatgt ... ggtatgacagCTTGTGTTGAGCACTGGAAATGGAGTAAACGGTTTCACCCTTGATCCTTCC
EST: GAACAGACATGCTTGCTGCTGGCTACTGCATGTACGGGAGTTCATGCACG CTTGTGTTGAGCACTGGAAATGGAGTAAACGGTTTCACCCTTGATCCTTCCEST: gi|29656833|gb|CB653108.1|CB653108
genomic: GAACAGACATGCTTGCTGCTGGCTACTGCATGTACGGGAGTTCATGCACGgtaaccatgt ... ggtatgacagCTTGTGTTGAGCACTGGAAATGGAGTAAACGGTTTCACCCTTGATCCTTCC
EST: GAACAGACATGCTTGCTGCTGGCTACTGCATGTACGGGAGTTCATGCACG CTTGTGTTGAGCACTGGAAATGGAGTAAACGGTTTCACCCTTGATCCCTTC
genomic: GAACAGACATGCTTGCTGCTGGCTACTGCATGTACGGGAGTTCATGCACGgtaaccatgt ... ggtatgacagCTTGTGTTGAGCACTGGAAATGGAGTAAACGGTTTCACCCTTGATCC-TTC
ttcagatatatcacatgtactctcttcctaaatagacttggttctggtatgacagCTTGTGTTGAGCACTGGAAATGGAGTAAACGGTTTCACCCTTGATCCTTCCCTTGGGGAGTTCATTCTGACTCATCCAAACATCAAG
tcctaaa putative branch site (score: 2)
atatatca TA-rich tract