1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
...tttactctctgctcagcttttgctcaataaatactgtaagcatttatattcgctttcccttgtgctgttctgaaattcattgtgatgttctgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGTATGTTATCCTCCCCAAGGACTTCGAGAAGGGTTACCGAACCAATGTCA
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os02g21970.1 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|10794846|gb|AU108812.1|AU108812
genomic: AATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: GTGCTGCTGAT ATTGCCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGC-AAAATCGEST: gi|86599154|gb|CI355771.1|CI355771
genomic: GTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTG-CTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTTCTGAT ATTGGTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|88988222|gb|CI036192.1|CI036192
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATC-G
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCCAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|88247517|gb|CI247366.1|CI247366
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|88993480|gb|CI110301.1|CI110301
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|88524621|gb|CI453459.1|CI453459
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: ATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGTTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|89194535|gb|CI116972.1|CI116972
genomic: ATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|88221562|gb|CI221518.1|CI221518
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|88444331|gb|CI555048.1|CI555048
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|29659074|gb|CB655349.1|CB655349
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|11564715|gb|AU165351.1|AU165351
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|87035104|gb|CI189727.1|CI189727
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|86501980|gb|CI144613.1|CI144613
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|88221302|gb|CI221258.1|CI221258
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|88512683|gb|CI440189.1|CI440189
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: AGATTATGTTTCCAGACCAGATGAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTAGGCATGCTGTGCGCGAAAATCGGEST: gi|86853412|gb|CI327890.1|CI327890
genomic: AGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTCCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGGCTGCGCGCAAAAATCGEST: gi|29624229|gb|CB629240.1|CB629240
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCAT-GCTGTGCGCAAAAATCG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|87033424|gb|CI188048.1|CI188048
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|88996844|gb|CI389510.1|CI389510
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TCCACACCAGATAAAATTAGTGCGGCTGAT A-TGCTCCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATTCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|88993805|gb|CI112709.1|CI112709
genomic: TCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|86503025|gb|CI145658.1|CI145658
genomic: TATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|29656424|gb|CB652699.1|CB652699
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|88449415|gb|CI533974.1|CI533974
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|86505292|gb|CI147925.1|CI147925
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|88843994|gb|CI008575.1|CI008575
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|88516342|gb|CI443996.1|CI443996
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|29683628|gb|CB679903.1|CB679903
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|25798027|gb|CA753988.1|CA753988
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAANATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|89184394|gb|CI046959.1|CI046959
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCCAAAATCGGEST: gi|89190189|gb|CI392239.1|CI392239
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCT-TCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|86538182|gb|CI178388.1|CI178388
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|89195713|gb|CI393742.1|CI393742
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: GTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTTTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|88218762|gb|CI218611.1|CI218611
genomic: GTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: AGTGCTGCTGAT AGTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|29636555|gb|CB641564.1|CB641564
genomic: AGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|86859555|gb|CI278928.1|CI278928
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCCCAAAAATCGGEST: gi|88256843|gb|CI354624.1|CI354624
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: ATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|89177204|gb|CI043707.1|CI043707
genomic: ATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|29624228|gb|CB629239.1|CB629239
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATEST: gi|88221274|gb|CI221230.1|CI221230
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTAT
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|86836316|gb|CI348258.1|CI348258
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTTTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|86601860|gb|CI258536.1|CI258536
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|89183380|gb|CI045945.1|CI045945
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|86832828|gb|CI332434.1|CI332434
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|86413612|gb|CI019197.1|CI019197
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|86495973|gb|CI138606.1|CI138606
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCACAAAATCGEST: gi|29628786|gb|CB633797.1|CB633797
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCA-AAAATCG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|86503152|gb|CI145785.1|CI145785
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|86427789|gb|CI072886.1|CI072886
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|88227444|gb|CI226924.1|CI226924
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|29624299|gb|CB629310.1|CB629310
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|89168795|gb|CI020876.1|CI020876
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|88248544|gb|CI248393.1|CI248393
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGEST: gi|86432093|gb|CI085704.1|CI085704
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
EST: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGAT ATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
genomic: TTGATTTGGAAGATTATGTTTCCAGACCAGATAAAATTAGTGCTGCTGATgtgagtatca ... tgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGG
atattcgctttcccttgtgctgttctgaaattcattgtgatgttctgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGTATGTTATCCTCCCCAAGGACTTCGAGAAGGGTTACCGAACCAATGTCA
ttctgtttttc CT-rich tract
aaattcatt TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| tttactctctgctcagcttttgctcaataaatactgtaagcatttatattcgctttcccttgtgctgttctgaaattcattgtgatgttctgtttttcagATTGCTGCTATCTGTCAAGAAGCTGGTATGCATGCTGTGCGCAAAAATCGGTATGTTATCCTCCCCAAGGACTTCGAGAAGGGTTACCGAACCAATGTCA
- - - ctctgct
- - - - - - - - cttttgc
- - - - - - - - - - - - caataaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tgctgtt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tgtgatg