Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...taggtgggaaataaaaataatactgtacttggtggcaccattgcccttgtttaaaaggagtatagattctgagaaaatgtggtctttattggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTGAGACTGACGAGGCGGTGGCAGGGGAGGTTGCAGCAGCTGAGTAGAGAT

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os02g18550.1
intron # 5
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|218482705|gb|FG963546.1|FG963546
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|86835774|gb|CI348211.1|CI348211
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTTACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88526583|gb|CI454656.1|CI454656
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88478024|gb|CI415295.1|CI415295
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|66914069|gb|CX100917.1|CX100917
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|89178872|gb|CI391870.1|CI391870
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88479496|gb|CI416767.1|CI416767
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88436068|gb|CI516604.1|CI516604
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATTTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88287397|gb|CI505088.1|CI505088
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|33687683|gb|CF315922.1|CF315922
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88995348|gb|CI036923.1|CI036923
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88292105|gb|CI534899.1|CI534899
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88303985|gb|CI513059.1|CI513059
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88476106|gb|CI413377.1|CI413377
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88420022|gb|CI516471.1|CI516471
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88294113|gb|CI510421.1|CI510421
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88283746|gb|CI405192.1|CI405192
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|3768838|gb|AU032865.1|AU032865
EST:     AGNTGAAGATCTTGAAGGCNCCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88568760|gb|CI499477.1|CI499477
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|10794795|gb|AU108761.1|AU108761
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|7652224|gb|AU089776.1|AU089776
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88217506|gb|CI217355.1|CI217355
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88518816|gb|CI445662.1|CI445662
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|13806235|gb|AU181434.1|AU181434
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|89190380|gb|CI015345.1|CI015345
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88469052|gb|CI504772.1|CI504772
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88508849|gb|CI436355.1|CI436355
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88293866|gb|CI507975.1|CI507975
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88283951|gb|CI405397.1|CI405397
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88484939|gb|CI422210.1|CI422210
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88484377|gb|CI421648.1|CI421648
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|163917976|gb|EG713138.1|EG713138
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88468503|gb|CI514985.1|CI514985
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88285122|gb|CI502459.1|CI502459
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88534527|gb|CI463254.1|CI463254
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|89192542|gb|CI016551.1|CI016551
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88487393|gb|CI424664.1|CI424664
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88459375|gb|CI517053.1|CI517053
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|3763664|gb|AU030416.1|AU030416
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|33690862|gb|CF319101.1|CF319101
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88520802|gb|CI447562.1|CI447562
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88487024|gb|CI424295.1|CI424295
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88287913|gb|CI510193.1|CI510193
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAGGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88514557|gb|CI442063.1|CI442063
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|86528407|gb|CI168613.1|CI168613
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|33692844|gb|CF321083.1|CF321083
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88413585|gb|CI526147.1|CI526147
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88506687|gb|CI434193.1|CI434193
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88531693|gb|CI460104.1|CI460104
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88515547|gb|CI443201.1|CI443201
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|55434421|gb|CV730333.1|CV730333
EST:     AGGTGAAGATTTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACCCGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88486346|gb|CI423617.1|CI423617
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|8324478|gb|AU091628.1|AU091628
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88505623|gb|CI433129.1|CI433129
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|58682236|gb|CK070923.1|CK070923
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|3768002|gb|AU032029.1|AU032029
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88502706|gb|CI430212.1|CI430212
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|89193315|gb|CI050613.1|CI050613
EST:     AGGTGAAAATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88503050|gb|CI430556.1|CI430556
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|55437151|gb|CV731774.1|CV731774
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88554508|gb|CI484691.1|CI484691
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCNAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88490478|gb|CI427750.1|CI427750
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88466074|gb|CI519947.1|CI519947
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88303077|gb|CI505689.1|CI505689
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|117246664|gb|CT863247.1|CT863247
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTAACA-GGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGC
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTA-CAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGC
EST: gi|218484338|gb|FG944231.1|FG944231
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88467518|gb|CI537160.1|CI537160
EST:     TTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: TTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88476656|gb|CI413927.1|CI413927
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88975212|gb|CI023463.1|CI023463
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88484531|gb|CI421802.1|CI421802
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|58662864|gb|CK051550.1|CK051550
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88970063|gb|CI383565.1|CI383565
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|23513540|gb|BU673185.1|BU673185
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|86546183|gb|CI186389.1|CI186389
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|33693182|gb|CF321421.1|CF321421
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACTCGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|86528436|gb|CI168642.1|CI168642
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88547868|gb|CI478196.1|CI478196
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|33687810|gb|CF316049.1|CF316049
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88287393|gb|CI505084.1|CI505084
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|3766601|gb|AU030711.1|AU030711
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88292114|gb|CI534908.1|CI534908
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|55438801|gb|CV732699.1|CV732699
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|86523587|gb|CI163793.1|CI163793
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|55439672|gb|CV733146.1|CV733146
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|88520491|gb|CI448145.1|CI448145
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
EST: gi|55434419|gb|CV730332.1|CV730332
EST:     AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAG                         GTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT
genomic: AGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCT

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 74 (upstream exon), 74 (downstream exon)
Score: 195

CGAGAAGTCAACTTCAAGTATATTCCCTCTCCAAAATGTGTTCATCCGCAAGGTGAAGATCTTGAAGGCACCGAAGTTTGATCTTGGGAAGTTGATGGAGgtgaggaacc ... ggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTGAGACTGACGAGGCGGTGGCAGGGGAGGTTGCAGCAGCTGAGTAGAGAT




<











<


<











 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

cttgtttaaaaggagtatagattctgagaaaatgtggtctttattggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTGAGACTGACGAGGCGGTGGCAGGGGAGGTTGCAGCAGCTGAGTAGAGAT
               tatagatt  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
taggtgggaaataaaaataatactgtacttggtggcaccattgcccttgtttaaaaggagtatagattctgagaaaatgtggtctttattggttttacagGTACACGGTGACTACAAGGAAGATGTCGGTATGAAGCTGGACAGGCCTGCTGAGACTGACGAGGCGGTGGCAGGGGAGGTTGCAGCAGCTGAGTAGAGAT

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  CAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGA
- - - - - - aaaaata
- - - - - - - - - - - - - - -tggtggc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aaaaggag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gattctg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -agaaaatg