1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
...ttaatatcattggacaagaatggataaaaatcgaggaacaagtcttctttgcaaaatgctaaaaaaaaataaatgagtacaaatattctggtttgtacagGTGAGCCTGAGAGAGCCTATTCGAGCTGGTGTTGATGATGCTGGACTCAGAGAAATAATAAGCGCTGCGGTATGTGTAGAAATTCACTTGGTTGACATCT
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os02g15870.4 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GACTATTGGCTGATGGCAACTTGAAAGTGTGCTTATTTGGCCCCTCAGAG GTGAGCCTGAGAGAGCCTATTCGAGTTGGTGTTGATGATGCTGGACTCAGAEST: gi|29629540|gb|CB634549.1|CB634549
genomic: GACTATTGGCTGATGGCAACTTGAAAGTGTGCTTATTTGGCCCCTCAGAGgtatgctaac ... gtttgtacagGTGAGCCTGAGAGAGCCTATTCGAGCTGGTGTTGATGATGCTGGACTCAGA
EST: GACTATTGGCTGATGGCAACTTGAAAGTGTGCTTATTTGGCCCCTCAGAG GTGAGCCTGAGAGAGCCTATTCGAGCTGGTGTTGATGATGCTGGACTCAGA
genomic: GACTATTGGCTGATGGCAACTTGAAAGTGTGCTTATTTGGCCCCTCAGAGgtatgctaac ... gtttgtacagGTGAGCCTGAGAGAGCCTATTCGAGCTGGTGTTGATGATGCTGGACTCAGA
tctttgcaaaatgctaaaaaaaaataaatgagtacaaatattctggtttgtacagGTGAGCCTGAGAGAGCCTATTCGAGCTGGTGTTGATGATGCTGGACTCAGAGAAATAATAAGCGCTGCGGTATGTGTAGAAATTCACTTGGTTGACATCT
tgctaaa putative branch site (score: 2)
aaaatgctaaaaaaaa TA-rich tract