Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtatgctggtaccattagtttgatataacacacagaaattggctgttgacatttccctttcttgttacctttgacatttcgctttcgttttacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTCCAG

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os01g46610.1
intron # 5
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os01g46610.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 5
lower sequence: GRMZM2G432128_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 5
gtatgctggtaccattagtttgatataacacacagaaattggctgttgacatttccctttcttgttacctttgacatttcgctttcgttttacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTCCAG
                    | |  || |      || |||  ||  |   | |   ||   ||||     | | |||||   | | | |||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||
-------------------gtaaagta-cctttgaaatttgaatgcagtactctagtttggctgttgaagcttatatttc---tgcttgttac-ttttagGCACTGTGTTCAGAGAGCCTATTATATGCAAAAACGTTCCAAGACTTGTTCCAG

upper sequence: LOC_Os01g46610.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 5
lower sequence: GRMZM2G033515_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 5
gtatgctggtaccattagtttgatataacacacagaaattggctgttgacatttccctttcttgttacctttgacatttcgctttcgttttacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTCCAG
|||   |  |   ||   ||  ||  |  ||||| |  |||||| ||||   ||||||||||                  ||||   |||||    | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
gtaaagttcttttatagtttgaatgcattacacatagtttggctattgaagcttccctttct------------------gcttgtttttta----ttagGTACTGTGTTCAGAGAACCAATTATATGCAAAAACGTTCCAAGGCTTGTTCCAG
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|58662871|gb|CK051557.1|CK051557
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|29675350|gb|CB671625.1|CB671625
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58678495|gb|CK067182.1|CK067182
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58695560|gb|CK084247.1|CK084247
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58610693|gb|CK038405.1|CK038405
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTT
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTT
EST: gi|58606127|gb|CK034160.1|CK034160
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATCTGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|88399083|gb|CI603750.1|CI603750
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGA
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGA
EST: gi|88389850|gb|CI626619.1|CI626619
EST:     AAAGCAAATGTGGAACAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACCTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCAC-TGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCC
EST: gi|572311|gb|D41822.1|D41822
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58656887|gb|CK045567.1|CK045567
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58589191|gb|CF987499.1|CF987499
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58607291|gb|CK035324.1|CK035324
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58667102|gb|CK055788.1|CK055788
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTAATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTT
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTA-TTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTT
EST: gi|58659479|gb|CK048159.1|CK048159
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|29635621|gb|CB640630.1|CB640630
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTT
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTT
EST: gi|58679016|gb|CK067703.1|CK067703
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58691522|gb|CK080209.1|CK080209
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58587564|gb|CF985872.1|CF985872
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|88385801|gb|CI566663.1|CI566663
EST:     AAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAACTGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAA-TGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58666863|gb|CK055549.1|CK055549
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58681761|gb|CK070448.1|CK070448
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58691966|gb|CK080653.1|CK080653
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTC
EST: gi|58670722|gb|CK059408.1|CK059408
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58685196|gb|CK073883.1|CK073883
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58662324|gb|CK051004.1|CK051004
EST:     AGAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|29643695|gb|CB648702.1|CB648702
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58674328|gb|CK063014.1|CK063014
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58686068|gb|CK074755.1|CK074755
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|33794465|gb|CF323117.1|CF323117
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58663486|gb|CK052172.1|CK052172
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58688143|gb|CK076830.1|CK076830
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58657858|gb|CK046538.1|CK046538
EST:     AAGCACAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAGCA-AATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58607758|gb|CK035791.1|CK035791
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|29681045|gb|CB677320.1|CB677320
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|33796466|gb|CF324100.1|CF324100
EST:     GTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: GTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58660728|gb|CK049408.1|CK049408
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|33678138|gb|CF306377.1|CF306377
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58656654|gb|CK045334.1|CK045334
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58595435|gb|CK005963.1|CK005963
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58591977|gb|CF990285.1|CF990285
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58601443|gb|CK011971.1|CK011971
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCCATTATATGCCAAAATGTCCCCAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58684521|gb|CK073208.1|CK073208
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|88368187|gb|CI575069.1|CI575069
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCC-AAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58590514|gb|CF988822.1|CF988822
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58668052|gb|CK056738.1|CK056738
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58657351|gb|CK046031.1|CK046031
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|33683368|gb|CF311607.1|CF311607
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|88417329|gb|CI578990.1|CI578990
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTAT
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTAT
EST: gi|58607608|gb|CK035641.1|CK035641
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|33676653|gb|CF304892.1|CF304892
EST:     GGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: GGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|33795162|gb|CF323454.1|CF323454
EST:     GGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: GGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58662930|gb|CK051616.1|CK051616
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|33676462|gb|CF304701.1|CF304701
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58613085|gb|CK040797.1|CK040797
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58688403|gb|CK077090.1|CK077090
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58690817|gb|CK079504.1|CK079504
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|163918210|gb|EG714014.1|EG714014
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58606037|gb|CK034070.1|CK034070
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGACTATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|88357147|gb|CI616034.1|CI616034
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGA
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGA
EST: gi|58663612|gb|CK052298.1|CK052298
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58670942|gb|CK059628.1|CK059628
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|29612963|gb|CB617976.1|CB617976
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58688036|gb|CK076723.1|CK076723
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58656783|gb|CK045463.1|CK045463
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|33676140|gb|CF304379.1|CF304379
EST:     GGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: GGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|38468398|gb|CF952529.1|CF952529
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58600685|gb|CK011213.1|CK011213
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|29612961|gb|CB617974.1|CB617974
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58658151|gb|CK046831.1|CK046831
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|29663182|gb|CB659457.1|CB659457
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58611952|gb|CK039664.1|CK039664
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|33796234|gb|CF323983.1|CF323983
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|33795371|gb|CF323556.1|CF323556
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58658238|gb|CK046918.1|CK046918
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|29671744|gb|CB668019.1|CB668019
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58693456|gb|CK082143.1|CK082143
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58662619|gb|CK051305.1|CK051305
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|2442742|gb|C74513.1|C74513
EST:     AAAGCNAATGTGGAAGAGCCCCAATGGNACAATTAGGAATATTATCAATG                         GGACTTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAA
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACT-GTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAA
EST: gi|58671532|gb|CK060218.1|CK060218
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAG
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAG
EST: gi|58675276|gb|CK063963.1|CK063963
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58689712|gb|CK078399.1|CK078399
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58662447|gb|CK051133.1|CK051133
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|38473345|gb|CF957477.1|CF957477
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58612758|gb|CK040470.1|CK040470
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|163921089|gb|EG710428.1|EG710428
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58665675|gb|CK054361.1|CK054361
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|33676366|gb|CF304605.1|CF304605
EST:     GGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: GGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58589710|gb|CF988018.1|CF988018
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATG
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATG
EST: gi|58676343|gb|CK065030.1|CK065030
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGACAATTATATGCAAAAAT
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAAT
EST: gi|58654325|gb|CK043005.1|CK043005
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58681694|gb|CK070381.1|CK070381
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCGATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58676125|gb|CK064812.1|CK064812
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58592343|gb|CF990651.1|CF990651
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|11442840|gb|BF430739.1|BF430739
EST:     GCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: GCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|33676128|gb|CF304367.1|CF304367
EST:     GGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: GGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|29674012|gb|CB670287.1|CB670287
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58676638|gb|CK065325.1|CK065325
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58688940|gb|CK077627.1|CK077627
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58659978|gb|CK048658.1|CK048658
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCA
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCA
EST: gi|58665202|gb|CK053888.1|CK053888
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|29635286|gb|CB640295.1|CB640295
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58607745|gb|CK035778.1|CK035778
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|29636156|gb|CB641165.1|CB641165
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCACAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58605729|gb|CK033762.1|CK033762
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58665127|gb|CK053813.1|CK053813
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58606311|gb|CK034344.1|CK034344
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCA
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCA
EST: gi|58661012|gb|CK049692.1|CK049692
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|117251413|gb|CT844156.1|CT844156
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|33795997|gb|CF323866.1|CF323866
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|58681524|gb|CK070211.1|CK070211
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
EST: gi|286473|gb|D15280.1|D15280
EST:     AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATG                         GCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC
genomic: AAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTC

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 75 (upstream exon), 69 (downstream exon)
Score: 185

ATGAGGCTCGGGTTAAGGAGTTCAACCTAAAGCAAATGTGGAAGAGCCCCAATGGCACAATTAGGAATATTATCAATGgtatgctggt ... tacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTCCAG




<











<


<











 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ttgacatttccctttcttgttacctttgacatttcgctttcgttttacctttcagGCACTGTATTCAGAGAGCCAATTATATGCAAAAATGTCCCAAGGCTTGTTCCAG
                               tttcgctttcgtttta  CT-rich tract
                                          tttta  TA-rich tract