1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
...ctaggaacgtaaaatacatcctgattgatggaatgtgcatttgaaaaatgttttgcaatcacagtacagcttacatatttgccttttctactgctgtcagACTATTGTTGCTCAAATTAATCACGCAATTGGAGCTGAGGGAATTGTTAGTATGGAATGCAAACAAGTTGTGCGGGACTACGGGGACATGATCCTCGAGA
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os01g18630.2 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
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aaatgttttgcaatcacagtacagcttacatatttgccttttctactgctgtcagACTATTGTTGCTCAAATTAATCACGCAATTGGAGCTGAGGGAATTGTTAGTATGGAATGCAAACAAGTTGTGCGGGACTACGGGGACATGATCCTCGAGA
agcttac putative branch site (score: 3)
tttgccttttctact putative PPT
ttacatattt TA-rich tract