1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' |
gtagctgcttgaacttaaaactgcagctttcttgtgtgatttgttagattaagatctgatgagacatgactgtttttaccttttagGGGCTCTCCAAGTTATGGTGCTCCTAAAGGAAGCTGGGCTAAAACCTGATTGTAAACTTTACACAACACTTATATCGACTTGTGCCAAGTGTGGAAAAGT
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os10g10170.1 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TACCTTCAATATGCTTTTATCTGTGTGCGCTAATTCGCAAGATTTTGATG GGGCTCTCCAAGTTATGGTGCTCCTAAAGGAAGCTGGGCTAAAACCTGATTEST: gi|29614515|gb|CB619528.1|CB619528
genomic: TACCTTCAATATGCTTTTATCTGTGTGCGCTAATTCGCAAGATTTTGATGgtagctgctt ... taccttttagGGGCTCTCCAAGTTATGGTGCTCCTAAAGGAAGCTGGGCTAAAACCTGATT
EST: TACCTTCAATATGCTTTTATCTGTGTGCGCTAATTCTCAAGATTTTGATG GGGCTCTCCAAGTTATGGTGCTCCTAAAGGAAGCTGGGCTAAAACCTGATTEST: gi|38481669|gb|CF965758.1|CF965758
genomic: TACCTTCAATATGCTTTTATCTGTGTGCGCTAATTCGCAAGATTTTGATGgtagctgctt ... taccttttagGGGCTCTCCAAGTTATGGTGCTCCTAAAGGAAGCTGGGCTAAAACCTGATT
EST: TACCTTCAATATGCTTATATCTGTGTGCGCTAATTCGCAAGATTTTGATG GGGCTCTCCAAGTTATGGTGCTCCTACAGGAAGCTGGGCTA
genomic: TACCTTCAATATGCTTTTATCTGTGTGCGCTAATTCGCAAGATTTTGATGgtagctgctt ... taccttttagGGGCTCTCCAAGTTATGGTGCTCCTAAAGGAAGCTGGGCTA
ttgtgtgatttgttagattaagatctgatgagacatgactgtttttaccttttagGGGCTCTCCAAGTTATGGTGCTCCTAAAGGAAGCTGGGCTAAAACCTGATTGTAAACTTTACACAACACTTATATCGACTTGTGCCAAGTGTGGAAAAGT
atctgat putative branch site (score: 17)
ctgtttttacctttt putative PPT
atttgttagattaa TA-rich tract