1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' | 18 5' 3' |
gtaatttgctcatgcaccacattactgcttattttcaatgaaaccttcttggttggttgtcctcactctccctctttttggtttcagTTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGTTTGACTGCCAGTCCTGTAGTCAATCTCTCCAGTGTTTTTGGAACCAAGG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os09g19734.2 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAG TTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGTEST: gi|56157245|gb|D23596.2|D23596
genomic: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAGgtaatttgct ... ttggtttcagTTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGT
EST: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAG TTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGTEST: gi|29634623|gb|CB639632.1|CB639632
genomic: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAGgtaatttgct ... ttggtttcagTTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGT
EST: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAG TTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGTEST: gi|84117435|gb|CD151202.1|CD151202
genomic: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAGgtaatttgct ... ttggtttcagTTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGT
EST: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAG TTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGTEST: gi|33827852|gb|CF339741.1|CF339741
genomic: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAGgtaatttgct ... ttggtttcagTTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGT
EST: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAG TTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGTEST: gi|29634604|gb|CB639613.1|CB639613
genomic: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAGgtaatttgct ... ttggtttcagTTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGT
EST: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAG TTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGTEST: gi|58587649|gb|CF985957.1|CF985957
genomic: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAGgtaatttgct ... ttggtttcagTTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGT
EST: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAG TTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGTEST: gi|33802112|gb|CF326928.1|CF326928
genomic: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAGgtaatttgct ... ttggtttcagTTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGT
EST: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAG TTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGTEST: gi|163920092|gb|EG709862.1|EG709862
genomic: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAGgtaatttgct ... ttggtttcagTTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGT
EST: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAG TTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGTEST: gi|33827932|gb|CF339781.1|CF339781
genomic: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAGgtaatttgct ... ttggtttcagTTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGT
EST: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAG TTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGTEST: gi|33794658|gb|CF323216.1|CF323216
genomic: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAGgtaatttgct ... ttggtttcagTTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGT
EST: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAG TTTGAGCTTCAATACTCGCATGATNTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGEST: gi|33825589|gb|CF338605.1|CF338605
genomic: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAGgtaatttgct ... ttggtttcagTTTGAGCTTCAATACTCGCATGAT-TATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGG
EST: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAG TTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGT
genomic: GATTGAAGTCCATCTTGAGCTTTGCTGTTCCGGATCAAAGATCTGGAAAGgtaatttgct ... ttggtttcagTTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGT
tttcaatgaaaccttcttggttggttgtcctcactctccctctttttggtttcagTTTGAGCTTCAATACTCGCATGATTATGCTGGTGTTAGTGCAAGTATTGGTTTGACTGCCAGTCCTGTAGTCAATCTCTCCAGTGTTTTTGGAACCAAGG
tcctcac putative branch site (score: 2)
ttgtcctcactctccc CT-rich tract
tcttttt TA-rich tract