1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' |
gtgatactcttaaaccttctgagtgaccgctggtgtccactcataagcagctagagtgacgcagtcacattgaagtactgatatgtttgcattctgttcagGCTGGTTTTACTGGAATTGGTGTTGGTGCTGCCTATCAAGGTCTTCGCCCTGTGGTTGAGTTCATGACATTTAACTTCTCTATGCAG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os08g42410.1 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TGTTAGACAAATATGGCCCTGATAGGGTTCTTGACACACCAATCACAGAG GCTGGTTTTACTGGAATTGGTGTTGGTGCTGCCTATCAAGGTCTTCGCCCTEST: gi|218484233|gb|FG953202.1|FG953202
genomic: TGTTAGACAAATATGGCCCTGATAGGGTTCTTGACACACCAATCACAGAGgtgatactct ... ttctgttcagGCTGGTTTTACTGGAATTGGTGTTGGTGCTGCCTATCAAGGTCTTCGCCCT
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gcagctagagtgacgcagtcacattgaagtactgatatgtttgcattctgttcagGCTGGTTTTACTGGAATTGGTGTTGGTGCTGCCTATCAAGGTCTTCGCCCTGTGGTTGAGTTCATGACATTTAACTTCTCTATGCAG
tactgat putative branch site (score: 2)
ttctgttc putative PPT
atatgttt TA-rich tract