1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
...atggtcatcattgcacgggtggccatttttaaatatgcagtcatttcaatgtgatagtacggtgcaaatttatatatgattcatttttctggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTGGCCTTCGGGTCTGGCGTTCAGTGTTACTGCAACTACTGGAACCTAGGG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os08g34480.1 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88568606|gb|CI499323.1|CI499323
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGGATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88478323|gb|CI415594.1|CI415594
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88209922|gb|CI209771.1|CI209771
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88565489|gb|CI496206.1|CI496206
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88480256|gb|CI417527.1|CI417527
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88293248|gb|CI500534.1|CI500534
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88569120|gb|CI499837.1|CI499837
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88534133|gb|CI462829.1|CI462829
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: TCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88484514|gb|CI421785.1|CI421785
genomic: TCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGGTTACAATTTTATGCAG AAAATGGTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|86511433|gb|CI154066.1|CI154066
genomic: CATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGC-GTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|86511143|gb|CI153776.1|CI153776
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88293418|gb|CI503001.1|CI503001
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CATTNCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATNCTACTTCCNTNTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88435017|gb|CI504359.1|CI504359
genomic: CATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88538166|gb|CI467173.1|CI467173
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CTGAGAATGGATCCATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88532225|gb|CI461695.1|CI461695
genomic: CTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88293143|gb|CI500429.1|CI500429
genomic: CGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88373712|gb|CI506139.1|CI506139
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATCCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|86855685|gb|CI269012.1|CI269012
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAGTTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88434540|gb|CI501966.1|CI501966
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: TTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88565995|gb|CI496712.1|CI496712
genomic: TTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: GAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88285436|gb|CI507306.1|CI507306
genomic: GAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGTTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88557386|gb|CI487786.1|CI487786
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: AAGAGAGCGTTACCATTTTATGCAG GAAATGGTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGNTEST: gi|86526146|gb|CI166352.1|CI166352
genomic: AAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|87020191|gb|CI261055.1|CI261055
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88210251|gb|CI210100.1|CI210100
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88553084|gb|CI483157.1|CI483157
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88292691|gb|CI505270.1|CI505270
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGA-GTEST: gi|88213767|gb|CI213616.1|CI213616
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|186893103|gb|FG124788.1|FG124788
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACTAAAATTGAGGTEST: gi|88533420|gb|CI460975.1|CI460975
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGGTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|86507382|gb|CI150015.1|CI150015
genomic: CTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88418918|gb|CI508871.1|CI508871
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88955817|gb|CI092106.1|CI092106
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88381961|gb|CI530767.1|CI530767
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTNCTGAGAATGGATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTGTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88548994|gb|CI478838.1|CI478838
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: ATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGG AAAATGCTACTTCCGTNTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGEST: gi|86526156|gb|CI166362.1|CI166362
genomic: ATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCA-Ggtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGG
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88467615|gb|CI507040.1|CI507040
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88564133|gb|CI494850.1|CI494850
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88546404|gb|CI476038.1|CI476038
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: TTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88301671|gb|CI503137.1|CI503137
genomic: TTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88293979|gb|CI510287.1|CI510287
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88566186|gb|CI496903.1|CI496903
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: TCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88567882|gb|CI498599.1|CI498599
genomic: TCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: GCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88435400|gb|CI509071.1|CI509071
genomic: GCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88528162|gb|CI454381.1|CI454381
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88279748|gb|CI400946.1|CI400946
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACCATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88567475|gb|CI498192.1|CI498192
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG GAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTTAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|86598009|gb|CI278399.1|CI278399
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCCATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88563749|gb|CI494466.1|CI494466
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88301750|gb|CI503216.1|CI503216
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88418875|gb|CI508828.1|CI508828
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88277381|gb|CI398183.1|CI398183
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTEST: gi|88240818|gb|CI238669.1|CI238669
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
EST: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAG AAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
genomic: CCATTGCTGAGAATGAATCAATTGGAAGAGAGCGTTACAATTTTATGCAGgtatgttaaa ... ggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGT
tcaatgtgatagtacggtgcaaatttatatatgattcatttttctggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTGGCCTTCGGGTCTGGCGTTCAGTGTTACTGCAACTACTGGAACCTAGGG
tttttctg CT-rich tract
aaatttatatatgatt TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| atggtcatcattgcacgggtggccatttttaaatatgcagtcatttcaatgtgatagtacggtgcaaatttatatatgattcatttttctggtgttgcagAAAATGCTACTTCCGTGTGGTCTGCCTCCTGAGAGAGACGAAGATTGAGGTGGCCTTCGGGTCTGGCGTTCAGTGTTACTGCAACTACTGGAACCTAGGG
- - - - cattgca
- - - - - - - - - - - - - - - - atatgca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tgtgata
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -cggtgca