1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtattactccattgctctttgcacttcggttaacatgttagactttcagtttctttgttcagtccaacttatattatgtttccagGTAATGGCTGTTATGTCAATGTGGACCAGATTACAACCACTTTATGCTTCTAACATGTGGAATGAGGCCCTTAATAAACGACTTGGGACTGAG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os08g32910.1 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GGATTGATACGATGTCAGACAATTATCCACCACCACTGGATGCTAACCTG GTAATGGCTGTTATGTCAATGTGGACCAGATTACAACCACTTTATGCTTCT
genomic: GGATTGATACGATGTCAGACAATTATCCACCACCACTGGATGCTAACCTGgtattactcc ... atgtttccagGTAATGGCTGTTATGTCAATGTGGACCAGATTACAACCACTTTATGCTTCT
taacatgttagactttcagtttctttgttcagtccaacttatattatgtttccagGTAATGGCTGTTATGTCAATGTGGACCAGATTACAACCACTTTATGCTTCTAACATGTGGAATGAGGCCCTTAATAAACGACTTGGGACTGAG
ggttaac putative branch site (score: 2)
tgtttcc putative PPT
aacttatattatgttt TA-rich tract