1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gtgggaaactagttatctgcgatatggttaaacaaaactcttctgatgagttacacctgttaaataattgcctttgttttcagTAAATCCTAAACGAGCAGCACTGTTCTATGATAACTCTCTCTCTGGTGAAGACATCTACGACCCTTTCCTAAGTTAAGTATTCTAGAATTGTATATGTTC
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os07g36465.1 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GGAAGATACTGTTGAATATGTGCTTGCCCTGATTGATGAGATGCTTGCAG TAAATCCTAAACGAGCAGCACTGTTCTATGATAACTCTCTCTCTNGTGAAGEST: gi|88389201|gb|CI597999.1|CI597999
genomic: GGAAGATACTGTTGAATATGTGCTTGCCCTGATTGATGAGATGCTTGCAGgtgggaaact ... ttgttttcagTAAATCCTAAACGAGCAGCACTGTTCTATGATAACTCTCTCTCTGGTGAAG
EST: GGAAGATACTGTTGAATATGTGCTTGCCCTGATTGATGAGATGCTTGCAG TAAATCCTAAACGAGCAGCACTGTTCTATGEST: gi|88449975|gb|CI572106.1|CI572106
genomic: GGAAGATACTGTTGAATATGTGCTTGCCCTGATTGATGAGATGCTTGCAGgtgggaaact ... ttgttttcagTAAATCCTAAACGAGCAGCACTGTTCTATG
EST: GGAAGATACTGTTGAATATGTGCTTGCCCTGATTGATGAGATGCTTGCAG TAAATCCTAAACGAGCAGCACTGTTCTATGATAACTCTCTCTCTGGTGAAGEST: gi|88344988|gb|CI625834.1|CI625834
genomic: GGAAGATACTGTTGAATATGTGCTTGCCCTGATTGATGAGATGCTTGCAGgtgggaaact ... ttgttttcagTAAATCCTAAACGAGCAGCACTGTTCTATGATAACTCTCTCTCTGGTGAAG
EST: GGAAGATACTGTTGAATATGTGCTTGCCCTGATTGATGAGATGCTTGCAG TAAATCCTAAACGAGCAGCACTGTTCTATGATAACTCTCTCTCTGGTGEST: gi|88417555|gb|CI581578.1|CI581578
genomic: GGAAGATACTGTTGAATATGTGCTTGCCCTGATTGATGAGATGCTTGCAGgtgggaaact ... ttgttttcagTAAATCCTAAACGAGCAGCACTGTTCTATGATAACTCTCTCTCTGGTG
EST: GGAAGATACTGTTGAATATGTGCTTGCCCTGATTGATGAGATGCTTGCAG TAAATCCTAAACGAGCAGCACTGTTCTATGATAACTCTCTCTCTGGTGAAGEST: gi|58670310|gb|CK058996.1|CK058996
genomic: GGAAGATACTGTTGAATATGTGCTTGCCCTGATTGATGAGATGCTTGCAGgtgggaaact ... ttgttttcagTAAATCCTAAACGAGCAGCACTGTTCTATGATAACTCTCTCTCTGGTGAAG
EST: GGAAGATACTGTTGAATATGTGCTTGCCCTGATTGATGAGATGCTTGCAG TAAATCCTAAACGAGCAGCACTGTTCTATGATAACTCTCTCTCTGGTGAAGEST: gi|58659574|gb|CK048254.1|CK048254
genomic: GGAAGATACTGTTGAATATGTGCTTGCCCTGATTGATGAGATGCTTGCAGgtgggaaact ... ttgttttcagTAAATCCTAAACGAGCAGCACTGTTCTATGATAACTCTCTCTCTGGTGAAG
EST: GGAAGATACTGTTGAATATGTGCTTGCCCTGATTGATGAGATGCTTGCAG TAAATCCTAAACGAGCAGCACTGTTCTATGATAACTCTCTCTCTGGTGAAG
genomic: GGAAGATACTGTTGAATATGTGCTTGCCCTGATTGATGAGATGCTTGCAGgtgggaaact ... ttgttttcagTAAATCCTAAACGAGCAGCACTGTTCTATGATAACTCTCTCTCTGGTGAAG
taaacaaaactcttctgatgagttacacctgttaaataattgcctttgttttcagTAAATCCTAAACGAGCAGCACTGTTCTATGATAACTCTCTCTCTGGTGAAGACATCTACGACCCTTTCCTAAGTTAAGTATTCTAGAATTGTATATGTTC
ttctgat putative branch site (score: 55)
ttgcctttgttttc putative PPT
tgttaaataatt TA-rich tract