Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...tgctacttgtgtggaagcacttatgtaccttagaatagcatgatattgttgtatctccatttgttttactttcctaacattttccttttatcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCCCATATATGATGTAGCTGCTATACTCACATCCATCCAG

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os05g08960.1
intron # 4
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os05g08960.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: GRMZM2G110983_T03 (Zea mays), 3'ss of exon 2
----tgctacttgtgtggaagcacttatgtaccttagaatagcatgatattgttgtatctccatttgttt-tactttcctaacattttccttttatcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCCCATATATGATGTAGCTGCTATACTCACATCCATCCAG
    |    ||| |   ||  ||  | | |    || |  |   |  |||  |   ||  ||| || | | |     ||| ||||||| ||     ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||
ctcctctggcttattctgatacaactctcttaactatatgatggtactatcttctaatgcccacttatatgtgtcaccctgacatttttct-----catatgcagTTTATGCTGATGGAAGCATATGCTTAGATATCCTGCAGAATCAGTGGAGTCCGATATATGATGTAGCTGCGATACTCACGTCAATCCAG

upper sequence: LOC_Os05g08960.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: GRMZM2G110983_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 3
tgctacttgtgtggaagcacttatgtaccttagaatagcatgatattgttgtatctccatttgttttactttcctaacattttccttttatcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCCCATATATGATGTAGCTGCTATACTCACATCCATCCAG
                     | |  ||  ||  || | |  || || |  |  |  | | | | |      ||| ||||||| ||     ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||
---------------------tcttaactatatgatggtactatcttctaatgcccacttatatgt-gtcaccctgacatttttct-----catatgcagtttatgctgatggaagcatatgcttagATATCCTGCAGAATCAGTGGAGTCCGATATATGATGTAGCTGCGATACTCACGTCAATCCAG

upper sequence: LOC_Os05g08960.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: GLYMA04G34170.2 (Glycine max), 3'ss of exon 4
tgctacttgtgtggaagcacttatgtaccttagaatagcatgatattgttgtatctcca---tttgttttactttcctaacattttccttttatcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCCCATATATGATGTAGCTGCTATACTCACATCCATCCAG
            | ||| | ||| ||      ||| | | | |  |||  |||||   |   || | | |      ||||    ||  ||  |    ||  ||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
------------gtaagta-ttaggtg-----gaaaatctttacgttggagtatcaataaatttagctgtgtagctctaattcattttttcaacttcgtgtagTTTATGCTGATGGAAGTATTTGTTTGGATATACTACAAAATCAGTGGAGTCCTATATATGATGTGGCTGCTATACTCACATCTATCCAG

upper sequence: LOC_Os05g08960.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: GLYMA05G01270.1 (Glycine max), 3'ss of exon 4
tgctacttgtgtggaagcacttatgtaccttagaatagcatgatattgttgtatctccatttgttttact-ttcctaacattttccttttatcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCCCATATATGATGTAGCTGCTATACTCACATCCATCCAG
            | |||   ||| ||      ||| ||  | || ||  | |   |  |||   | |     | ||||  |  |  || ||   |    ||||||||| ||||| || || || || |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||
------------gtaagt-tttaggtg-----gaaaagattaatcttcctatccgtaaattacctatgtagctactaatgtcatttttctactcttggaagTTTATGCGGATGGAAGTATTTGTTTGGATATATTACAAAACCAGTGGAGTCCTATATATGATGTAGCTGCTATACTCACTTCTATCCAG

upper sequence: LOC_Os05g08960.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: GLYMA17G10640.1 (Glycine max), 3'ss of exon 4
tgctacttgtgtggaagcacttatgtaccttagaatagcatgatattgttgtatctccatttgttttact-ttcctaacattttccttttatcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCCCATATATGATGTAGCTGCTATACTCACATCCATCCAG
            | |||   ||| ||      ||| ||  | || ||  |||   |  |||   | |     | ||||     |  || ||   ||   ||||||||| ||||| || || || || |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||
------------gtaagt-tttaggtg-----gaaaagattaatcttcatgtccataaattacctatgtagctactaatgccatttttctactctgggaagTTTATGCGGATGGAAGTATTTGTTTGGATATATTACAAAACCAGTGGAGTCCTATATATGATGTAGCTGCTATACTCACTTCTATCCAG

upper sequence: LOC_Os05g08960.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: GLYMA08G40860.1 (Glycine max), 3'ss of exon 4
tgctacttgtgtggaagcacttatgtaccttagaatagcatgatattgttgtatctccatttgttttacttt---cctaacattttcctt--ttatcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCCCATATATGATGTAGCTGCTATACTCACATCCATCCAG
     | |||||  |   |  | || |    | || |   |  |||  ||| |      |   ||| | | |    ||||     || ||  ||  ||  || ||||||||| ||||| || |||||||| || ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||
----tcctgtgttaatttaaat-tggagtacaaaacaattttgtatctttgcacgctagtaactttgaatctagttctaagcccctctttacttggcaattatagTTTATGCGGATGGCAGTATATGCTTGGACATTTTACAAAATCAGTGGAGCCCTATATATGATGTAGCTGCAATTCTTACCTCAATCCAG

upper sequence: LOC_Os05g08960.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: GLYMA06G20310.1 (Glycine max), 3'ss of exon 3
tgctacttgtgtggaagcactta-tgtaccttagaatagcatgatattgttgtatc--tccatttgttttactttcctaa--cattttccttttatcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCCCATATATGATGTAGCTGCTATACTCACATCCATCCAG
            | ||| | |   || |  || ||| | | | |  |||  |||||  |  ||| | | |      ||||  ||||||       |  |||  ||||||||||||||| || || || || |||||| ||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||
------------gtaagtattgggtggaaattggaaaatctttaccttggagtatcaataaattagctgtgtagctctaattcattttttcaactttgtgtgtagTTTATGCTGATGGAAGTATTTGTTTGGATATATTACAAAATCAGTGGAGTCCTATTTATGATGTGGCTGCTATACTCACATCTATCCAG

upper sequence: LOC_Os05g08960.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: AT1G14400.2 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 4
tgctacttgtgtggaagcacttatgtaccttagaatagcatgatattgttgtatctccatttgttttactttcctaacattttccttttatcat-gtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCCCATATATGATGTAGCTGCTATACTCACATCCATCCAG
 |  | || |   ||  ||    || |  ||  |    | || |  || ||| ||  | ||||  |    ||       || | || |  || | ||  ||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||||||
-gtaagttatagagatacaacattggattttctatccacctggt--tgatgt-tcagcttttgcctccaattaacgttcttctgctctattcgttgtgtagTTTATGCAGATGGGAGTATCTGCTTGGACATTCTACAAAACCAGTGGAGTCCAATCTATGATGTTGCTGCTATACTTACCTCCATCCAG

upper sequence: LOC_Os05g08960.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: AT5G62540.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 4
tgctacttgtgtggaagcacttatgtaccttagaatagcatgatattgttgtatctccatttgttttactttcctaacattttccttttatcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCCCATATATGATGTAGCTGCTATACTCACATCCATCCAG
            | |||| |     | |  | ||| | |||  || |     |  |       ||  |||||    | | ||    |||     || |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||||||||||||||| || || || |||||  | |||||||| || |||
------------gtaagcccaagcattcagt-gaacaacatagtaatagaccaa-ttaggaaattcgacttt---gataattgaactttg----gtgcagTTTATGCTGATGGAAGCATTTGCTTGGATATCTTGCAAAACCAGTGGAGCCCCATCTACGACGTTGCTGCAGTTCTCACATCAATTCAG

upper sequence: LOC_Os05g08960.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: AT2G02760.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 4
tgctacttgtgtggaagcacttatgtaccttagaatagcatgatattgttgtatctccatttgttttactttcctaacattttccttttatca----tgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCCCATATATGATGTAGCTGCTATACTCACATCCATCCAG
                     || ||     |  ||  ||| ||| | |  ||     | |   | |  |   | ||   |  |  ||  |||    ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||
--------------------gtaagttggagattatcacatcatagtttcttactctgagtacatgtgatcaacgaaagctcacacttggtcaatgttgtgcagTTTATGCTGATGGGAGTATATGCTTGGACATTCTCCAAAACCAATGGAGTCCAATATACGATGTCGCTGCTATACTAACCTCCATTCAG

upper sequence: LOC_Os05g08960.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: Vv01s0026g01770.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 5
-----tgctacttgtgtggaagcacttatgtaccttagaatagcatgatattgttgtatctccatttgttttactttcctaacattttccttttatcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCCCATATATGATGTAGCTGCTATACTCACATCCATCCAG
     || |  |  |    | |   |||  |   ||     | |   |    ||  ||| |    |  | || ||  |   |  || || |  | |  ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||
catgatgatgatcatcataatgtttttagcttttttgaggaaactaaactaagtattattt----tgctgttgctggctctaagttctcttaatcttttgt-cagTTTATGCGGATGGAAGCATTTGCTTAGACATTCTACAAAATCAGTGGAGTCCAATTTATGATGTAGCTGCCATACTTACATCCATCCAG

upper sequence: LOC_Os05g08960.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: Vv14s0108g00140.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 5
---tgctacttgtgtggaagcac-ttatgtaccttagaatagcatgatattgttgtatctccatttgttttactttcctaacattttccttttatcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCCCATATATGATGTAGCTGCTATACTCACATCCATCCAG
     |   || | |   |  |  || ||| |  | |      |||  |||  ||     |   |  |  || || ||| | |||||   |||   ||   |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || || ||||||
ctaccccttttattttttaatatattctgttctctggtgagaaatgtaattaatggtgtgcagctcataatagtt-cctgatatttttgcttttgaat---cagTATATGCCGATGGAAGCATCTGTTTGGATATTCTACAGAACCAGTGGAGTCCCATATATGATGTTGCTGCTATTCTTACTTCTATCCAG

upper sequence: LOC_Os05g08960.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: Vv17s0000g05820.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 4
tgctacttgtgtggaagcacttatgtaccttagaatagcatgatattgt-tgtatctccatttgttttactttcctaacattttcc-ttttatcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCCCATATATGATGTAGCTGCTATACTCACATCCATCCAG
       |  || | | |  |  || |  |||| ||  | | || ||   | | |||  |  ||   |   || ||   |  ||   ||||    ||  |||| ||||| ||||| || || ||  | ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || |||
------gtaagttggaactatgttgcaa-ttagtatcacttcatgttaaatatttctttagctgcggtttcttacttctaccttttattttgaattggccagTCTATGCAGATGGAAGTATTTGTCTCGATATTCTACAAAATCAGTGGAGTCCTATATATGATGTAGCAGCTATACTTACGTCTATTCAG

upper sequence: LOC_Os05g08960.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: Vv08s0032g00310.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
----------------------------------------------------------------------tgctacttgtgtggaagcacttat-gtaccttagaatagca-tgatattgttgtatctccatttgt-tttactttcctaacattttccttttatcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCCCATATATGATGTAGCTGCTATACTCACATCCATCCAG
                                                                      || | ||| |  | |   |  |||    |  ||| |    | | | | |||||| ||  |||| |  | || | ||  |     ||  | |     ||  |||||||||| ||||| || || ||||| |||||  |||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||
gtatgtcacaatcctattcttgaattgcattcctggttatgcaatatagatcataaactgcttatgcgaatgtttctttttggcatctatctattactctctaggactatactaacaatgttgtttccacattagcatctaatctctgactgcatttgtatgggtttgatcagTTTATGCAGATGGAAGTATTTGCTTGGATATTTTACAGAATCAGTGGAGTCCTATATATGATGTGGCAGCTATACTCACTTCCATCCAG

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|86596611|gb|CI286524.1|CI286524
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|88844273|gb|CI005646.1|CI005646
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|88560256|gb|CI490902.1|CI490902
EST:     CCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: CCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|88988531|gb|CI037767.1|CI037767
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|15850009|gb|BI798285.1|BI798285
EST:     AACAACCCACCCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTAC-AAACCAGTGGAGC
genomic: AACAAGCCA-CCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATG-CTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGC
EST: gi|11172348|gb|AU164240.1|AU164240
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|66915271|gb|CX102119.1|CX102119
EST:     TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|33677902|gb|CF306141.1|CF306141
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|88241857|gb|CI241706.1|CI241706
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|25800383|gb|CA756344.1|CA756344
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|88560096|gb|CI490726.1|CI490726
EST:     CTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGGTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: CTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|88564684|gb|CI495401.1|CI495401
EST:     TGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|218505588|gb|FG952847.1|FG952847
EST:     TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|86828978|gb|CI282739.1|CI282739
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|88470831|gb|CI408102.1|CI408102
EST:     TTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|88485225|gb|CI422496.1|CI422496
EST:     ATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: ATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|218493155|gb|FG956466.1|FG956466
EST:     TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|2311824|gb|C27979.1|C27979
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAG
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAG
EST: gi|33813641|gb|CF332707.1|CF332707
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|3767211|gb|AU031321.1|AU031321
EST:     AACAAGCCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: AACAAG-CCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|29619509|gb|CB624521.1|CB624521
EST:     TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|88218009|gb|CI217858.1|CI217858
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACTAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|86512221|gb|CI154854.1|CI154854
EST:     AGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: AGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|29619932|gb|CB624944.1|CB624944
EST:     TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|33656466|gb|CF279080.1|CF279080
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|88297132|gb|CI545222.1|CI545222
EST:     CGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: CGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|8857214|gb|AU094532.1|AU094532
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|38481076|gb|CF965165.1|CF965165
EST:     TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTCGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAAGCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|87033452|gb|CI188076.1|CI188076
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|88531902|gb|CI458423.1|CI458423
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|86846693|gb|CI282930.1|CI282930
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|88530423|gb|CI458818.1|CI458818
EST:     TTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|88254065|gb|CI352691.1|CI352691
EST:     TTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|88996140|gb|CI037431.1|CI037431
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|218504730|gb|FG949645.1|FG949645
EST:     TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|88532568|gb|CI462062.1|CI462062
EST:     CTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: CTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|29619508|gb|CB624520.1|CB624520
EST:     TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|86509286|gb|CI151919.1|CI151919
EST:     TAACAAGCTACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|33661335|gb|CF292302.1|CF292302
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATCTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTACATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|89170236|gb|CI039513.1|CI039513
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|87030298|gb|CI252575.1|CI252575
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|86510211|gb|CI152844.1|CI152844
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGCGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|88665600|gb|CI715756.1|CI715756
EST:     TAACAAGNCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGG
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGG
EST: gi|88349310|gb|CI678287.1|CI678287
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATG
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATG
EST: gi|89170677|gb|CI039954.1|CI039954
EST:     TGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|86509514|gb|CI152147.1|CI152147
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|86859772|gb|CI345426.1|CI345426
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|218478507|gb|FG954789.1|FG954789
EST:     TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|86834911|gb|CI345995.1|CI345995
EST:     CACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: CACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|58588665|gb|CF986973.1|CF986973
EST:     TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|86833840|gb|CI338211.1|CI338211
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|1632399|gb|C20128.1|C20128
EST:     NACAAGGCACCTACAAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTTGATGGGAGCATATG
genomic: AACAAGCCACCTACA-GTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCT-GATGGGAGCATATG
EST: gi|88220335|gb|CI219895.1|CI219895
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|33813642|gb|CF332708.1|CF332708
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|86260384|gb|CI066257.1|CI066257
EST:     CAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: CAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|86415688|gb|CI029699.1|CI029699
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|8858097|gb|AU095415.1|AU095415
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|29619931|gb|CB624943.1|CB624943
EST:     TAACAAGCCACCAACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|3767210|gb|AU031320.1|AU031320
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|88254945|gb|CI353769.1|CI353769
EST:     CTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: CTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
EST: gi|8527972|gb|AU092787.1|AU092787
EST:     TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACA                         TTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC
genomic: TAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCC

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 71 (upstream exon), 75 (downstream exon)
Score: 121

GTACGTTCAAGCTGACACTTCAGTTTACTGAAGATTATCCTAACAAGCCACCTACAGTGCGATTTGTTTCTCGGATGTTTCATCCTAACAgtaagcctct ... tcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCCCATATATGATGTAGCTGCTATACTCACATCCATCCAG




<











<


<











 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ttgttgtatctccatttgttttactttcctaacattttccttttatcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCCCATATATGATGTAGCTGCTATACTCACATCCATCCAG
                          tcctaac  putative branch site (score: 121)
                                cattttccttttatc  CT-rich tract
             atttgttttacttt  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
tgctacttgtgtggaagcacttatgtaccttagaatagcatgatattgttgtatctccatttgttttactttcctaacattttccttttatcatgtacagTTTATGCTGATGGGAGCATATGCTTAGATATACTACAAAACCAGTGGAGCCCCATATATGATGTAGCTGCTATACTCACATCCATCCAG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GCTGCT
tgctact
- - - - - - -gaagcac
- - - - - - - - - - - - - - - - - - agcatga
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ttgttgt