Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaagaaccttttggggcaaaattctcttatttcttatgtagtgcagtgttaaaaaggctttttccacccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCTGTTGCTTCAATGCCAAAATTGTCACCAGCTGCTTTTGACAAGCTTTTCA

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os05g01450.1
intron # 4
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os05g01450.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: GRMZM2G098153_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 4
-------------------gtaagaac-cttttggggcaaaattctcttatttctt----atgtagtgcagtgttaaaaaggctttttc-cacccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCTGTTGCTTCAATGCCAAAATTGTCACCAGCTGCTTTTGACAAGCTTTTCA
                     |   || ||  ||   |    || |  |||||  |    || || |     |      ||     | |  |   |  || |||| || || || ||||| || || | ||| || || ||  |||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||
gtacggatctctctctctctcactcactctcctgcatctgtttttttctattttattttgatttatttggacgcgggtgagtaacctccatatgacattgaagGAAGGACGCGTGGCACCTGATAACAGAATCGGAAGGTTGGTCTCTGAATCTGTTGCTTCAATGCCGAAATTGTCCCCAGCTGCTTTCGATAAGCTTTTCA

upper sequence: LOC_Os05g01450.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: GRMZM2G025214_T03 (Zea mays), 3'ss of exon 9
gtaagaaccttttggggcaaaattctcttatttcttatgtagtgcagtgttaaaaaggctttttccacccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCTGTTGCTTCAATGCCAAAATTGTCACCAGCTGCTTTTGACAAGCTTTTCA
||||| | || |   |  |  ||| || |||||  | || |    ||||| ||      | | |  |   |  ||||||| || || || ||||| ||||| | |||||| || |||||||||||| || |||||||  |||| |||||||| || |||||||| || |||       
gtaagcatctctcctgtgaccatt-tcctattttgtttggatgagagtgtcaaccg---tctctgtatgacgttgtagGAAGGACGCGTGGCACCCGACAACAGAATTGGAAGGTTCATCTCTGATTCTTTTGCTTCGGTGCCGAAATTGTCCCCGGCTGCTTTCGATAAG-------

upper sequence: LOC_Os05g01450.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: GRMZM2G025214_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 8
gtaagaaccttttggggcaaaattctcttatttcttatgtagtgcagtgttaaaaaggctttttccacccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCTGTTGCTTCAATGCCAAAATTGTCACCAGCTGCTTTTGACAAGCTTTTCA
||||| | || |   |  |  ||| || |||||  | || |    ||||| ||      | | |  |   |  ||||||| || || || ||||| ||||| | |||||| || |||||||||||| || |||||||  |||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||
gtaagcatctctcctgtgaccatt-tcctattttgtttggatgagagtgtcaaccg---tctctgtatgacgttgtagGAAGGACGCGTGGCACCCGACAACAGAATTGGAAGGTTCATCTCTGATTCTTTTGCTTCGGTGCCGAAATTGTCCCCGGCTGCTTTCGATAAGCTTTTCA

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|88472377|gb|CI409648.1|CI409648
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|88958697|gb|CI381500.1|CI381500
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGACCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|88475801|gb|CI413072.1|CI413072
EST:     TGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: TGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|87013558|gb|CI267259.1|CI267259
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|88843246|gb|CI372146.1|CI372146
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|25807581|gb|CA763542.1|CA763542
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|58595951|gb|CK006479.1|CK006479
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|58598359|gb|CK008887.1|CK008887
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|88279070|gb|CI400070.1|CI400070
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCTTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|2431154|gb|C73574.1|C73574
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|88483829|gb|CI421100.1|CI421100
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|88846943|gb|CI005922.1|CI005922
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|3760827|gb|C98081.1|C98081
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|88254568|gb|CI353392.1|CI353392
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|88417790|gb|CI535949.1|CI535949
EST:     CTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: CTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|88223674|gb|CI223523.1|CI223523
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|86596215|gb|CI268515.1|CI268515
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|88517976|gb|CI445529.1|CI445529
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|88239784|gb|CI238946.1|CI238946
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|33803402|gb|CF327575.1|CF327575
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|88210483|gb|CI210332.1|CI210332
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|86495486|gb|CI138119.1|CI138119
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|88507869|gb|CI435375.1|CI435375
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTAATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|88201915|gb|CI202270.1|CI202270
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|218486117|gb|FG963040.1|FG963040
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|86845759|gb|CI347044.1|CI347044
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|88996578|gb|CI389244.1|CI389244
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGGTGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAAT-AAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|88985008|gb|CI011864.1|CI011864
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|117237389|gb|CT861885.1|CT861885
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|33689596|gb|CF317835.1|CF317835
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|88213076|gb|CI212740.1|CI212740
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|88262599|gb|CI366373.1|CI366373
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAAATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|88458985|gb|CI555666.1|CI555666
EST:     GTATGTCCTGATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAAGAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: GTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
EST: gi|86259276|gb|CI007953.1|CI007953
EST:     AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTG                         GAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT
genomic: AGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCT

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 75 (upstream exon), 67 (downstream exon)
Score: 12

TGTGGAGAAGCTCCCCAATGATCTGGAAGGAATGGAATCCTCCATGGAAAAGCTGTATGTCCTTATTGACGAGATCTACAAATATGTTGATGATGTCGTGgtaagaacct ... ccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCTGTTGCTTCAATGCCAAAATTGTCACCAGCTGCTTTTGACAAGCTTTTCA




<











<


<











 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tctcttatttcttatgtagtgcagtgttaaaaaggctttttccacccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCTGTTGCTTCAATGCCAAAATTGTCACCAGCTGCTTTTGACAAGCTTTTCA
                                   ctttttccacccctat  CT-rich tract
     tatttcttat  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gtaagaaccttttggggcaaaattctcttatttcttatgtagtgcagtgttaaaaaggctttttccacccctatgtagGAGGGGCGTGTAGCACCGGACAATAAAATTGGGAGATTCATCTCTGATGCTGTTGCTTCAATGCCAAAATTGTCACCAGCTGCTTTTGACAAGCTTTTCA

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  CAAGCT