1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtaagtactccagtatccaatccagagtcacctcttgtacagatgccagtgtatacatatctaaaatctaagtttcacaatcgaaacatcattgatcaattgttgtctattaatgccagTTTACAGGAAAGCAGAGGATATGAATTATCACTCTGTATGTTTGCATGTTCTTGCCGATTCAGTACGGAG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os02g58580.1 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTCTTTCGGGAGCTATGCTCGTGTTAACCATAG TTTACAGGAAAGCAGAGGATATGAATTATCACTCTGTATGTTTGCATGTTEST: gi|29661174|gb|CB657449.1|CB657449
genomic: TTCTTTC-GGAGCTATGCTCGTGTTAA-CATAGgtaagtactc ... ttaatgccagTTTACAGGAAAGCAGAGGATATGAATTATCACTCTGTATGTTTGCATGTT
EST: TAATTTACTTGGTGTTTGGTTCTTTCGGAGCTATGCTCGTGTTAACATAG TTTACAGGAAAGCAGAGGATATGAATTATCACTCTGTATGTTTGCATGTTC
genomic: TAATTTACTTGGTGTTTGGTTCTTTCGGAGCTATGCTCGTGTTAACATAGgtaagtactc ... ttaatgccagTTTACAGGAAAGCAGAGGATATGAATTATCACTCTGTATGTTTGCATGTTC
aatctaagtttcacaatcgaaacatcattgatcaattgttgtctattaatgccagTTTACAGGAAAGCAGAGGATATGAATTATCACTCTGTATGTTTGCATGTTCTTGCCGATTCAGTACGGAG
tattaat putative branch site (score: 2)
tctattaat TA-rich tract