Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...tgtggatggcaacatccagtaatattcatggtgcatagtactaaattattacaaacttttatgtccgttgttttgatgtccactataccatcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGCCCAGATGCCATCAAGACTTCCAGCGAAGCATTGGACACCTGCAACACTA

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os02g07260.2
intron # 4
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os02g07260.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 5
lower sequence: GRMZM2G382914_T03 (Zea mays), 3'ss of exon 5
---tgtggatggcaacatccagtaatattcatggtgcatagtactaaattattacaaacttttatgtccgttgttttgatgtccactataccatcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGCCCAGATGCCATCAAGACTTCCAGCGAAGCATTGGACACCTGCAACACTA
   |||  || |  | ||    |  ||||  ||    |||||  |     | | ||       |      ||  |   |||   |||  |    | | | |||| |||  ||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || | |  ||||||||||||||||  ||| ||| 
cagtgttaatagtgatatgacatgttattt-tgtacgatagtttttccacagtgcagcaccggaaacaaatt--tgccatgctaacttgagtgacttctacagATTGTCCCTGCCACTGCTATCCCTGATGACTGGATGGGTCTTGATGTTGGCCCTGATGCCACCAAAACATTCGACGAAGCATTGGACACCACCAAGACTG

upper sequence: LOC_Os02g07260.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 5
lower sequence: AT1G79550.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 4
-----tgtggatggcaacatccagtaatattcatgg----tgcatagtactaaattattacaaacttttatgtccgttgttttgatgtccac-tataccatcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGCCCAGATGCCATCAAGACTTCCAGCGAAGCATTGGACACCTGCAACACTA
     | |    | ||   |     | | |  ||||    || ||   | ||||  |||  || | | |      ||   ||| | |   ||  |||  | |  || ||||  ||  | ||| | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| | |||||||||  |||||||   ||| || |
gtaactatcacagtcattgtggttgactctcaatgggccatgtatgaaagtaaaacatt-taagcgtctggtctggtctctttaaagctgacacatatga-ctcttgcagATAGTGCCAGCCACTGCCATCCCTGATGGCTGGATGGGTCTAGATATTGGTCCAGACTCCATCAAGACATTCAGCGAAGCTCTGGACACAACCAAAACCA
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|29656156|gb|CB652431.1|CB652431
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|33691339|gb|CF319578.1|CF319578
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|88974430|gb|CI021971.1|CI021971
EST:     GTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: GTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|86426370|gb|CI071467.1|CI071467
EST:     GCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: GCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|88976929|gb|CI257625.1|CI257625
EST:     TGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: TGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|33679036|gb|CF307275.1|CF307275
EST:     AGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: AGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|88974464|gb|CI022005.1|CI022005
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|87031162|gb|CI259742.1|CI259742
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGTAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|87022085|gb|CI259157.1|CI259157
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|27554292|gb|CA998192.1|CA998192
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|10611382|gb|AU108267.1|AU108267
EST:     TACCGATGTTGTAGTGGCTTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: TACCGATGTTGTAGTGGC-TGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|33678660|gb|CF306899.1|CF306899
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGC
EST: gi|10794618|gb|AU108584.1|AU108584
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|86595036|gb|CI260275.1|CI260275
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|58587693|gb|CF986001.1|CF986001
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|27554547|gb|CA998447.1|CA998447
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|88248576|gb|CI248425.1|CI248425
EST:     TGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: TGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|87024660|gb|CI259375.1|CI259375
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|86823859|gb|CI258848.1|CI258848
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|88844807|gb|CI021382.1|CI021382
EST:     ACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: ACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|9886211|gb|AU102104.1|AU102104
EST:     TACCGGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGNTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCCGATGGTTTGGATGGGTCTTGATGTTG
genomic: TACC-GATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTAT-CCCCGATGG-TTGGATGGGTCTTGATGTTG
EST: gi|88841872|gb|CI081128.1|CI081128
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|86488813|gb|CI131446.1|CI131446
EST:     TGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: TGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|86430404|gb|CI082827.1|CI082827
EST:     TGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: TGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|33679658|gb|CF307897.1|CF307897
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTCGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|86429753|gb|CI082176.1|CI082176
EST:     TTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: TTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|29614436|gb|CB619449.1|CB619449
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|27576779|gb|CA999473.1|CA999473
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|86601356|gb|CI251730.1|CI251730
EST:     GCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: GCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|88996413|gb|CI259917.1|CI259917
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|10794794|gb|AU108760.1|AU108760
EST:     CGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|8528265|gb|AU093080.1|AU093080
EST:     ATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCAATGGTTGAATGGGTCTTGAATGTTGG
genomic: ATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTG-ATGTTGG
EST: gi|58601567|gb|CK012095.1|CK012095
EST:     TACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: TACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|300216018|gb|HO088644.1|HO088644
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|88990492|gb|CI107883.1|CI107883
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGACGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|29659432|gb|CB655707.1|CB655707
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|86255860|gb|CI068309.1|CI068309
EST:     AGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: AGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|218484006|gb|FG948360.1|FG948360
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|29671337|gb|CB667612.1|CB667612
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|33688856|gb|CF317095.1|CF317095
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|29687384|gb|CB683659.1|CB683659
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|8527239|gb|AU092054.1|AU092054
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|89189247|gb|CI048786.1|CI048786
EST:     CTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|396941446|gb|HO188655.1|HO188655
EST:     TTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: TTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|88833403|gb|CI076884.1|CI076884
EST:     CCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|88847397|gb|CI011340.1|CI011340
EST:     GGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: GGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|8528062|gb|AU092877.1|AU092877
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|14574728|gb|AU197243.1|AU197243
EST:     ACCGATGTTGTAGTGGCTGAACAAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGC
genomic: ACCGATGTTGTAGTGGCTG-AC-AAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTG-CCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGG
EST: gi|33690622|gb|CF318861.1|CF318861
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTG
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTG
EST: gi|3760268|gb|C97524.1|C97524
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|88976894|gb|CI257590.1|CI257590
EST:     CCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTCCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|86256941|gb|CI061704.1|CI061704
EST:     GCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: GCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|87026835|gb|CI259488.1|CI259488
EST:     ACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: ACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|88840633|gb|CI080087.1|CI080087
EST:     TAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: TAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|33795493|gb|CF323616.1|CF323616
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTTGATGTTGG
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTT-GATGTTGG
EST: gi|218485468|gb|FG958213.1|FG958213
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|88996543|gb|CI260047.1|CI260047
EST:     ATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: ATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|24208507|gb|AU225534.1|AU225534
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|88248103|gb|CI246721.1|CI246721
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|33690950|gb|CF319189.1|CF319189
EST:     GATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: GATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|86823563|gb|CI256482.1|CI256482
EST:     TGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: TGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|33653530|gb|CF276144.1|CF276144
EST:     CAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|88839921|gb|CI017686.1|CI017686
EST:     ACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: ACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|33805002|gb|CF328378.1|CF328378
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTCACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGC
EST: gi|87026849|gb|CI259502.1|CI259502
EST:     GTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: GTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|66913056|gb|CX099904.1|CX099904
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|89181062|gb|CI045145.1|CI045145
EST:     TGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: TGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|33688761|gb|CF317000.1|CF317000
EST:     GCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGG
genomic: GCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTAT-CCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGG
EST: gi|88249786|gb|CI249635.1|CI249635
EST:     GATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: GATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|88971529|gb|CI017843.1|CI017843
EST:     ACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: ACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|29656604|gb|CB652879.1|CB652879
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|58684867|gb|CK073554.1|CK073554
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|3760230|gb|C97486.1|C97486
EST:     NTACNGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGG
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTG-CCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGG
EST: gi|87024263|gb|CI257004.1|CI257004
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCACAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|33689016|gb|CF317255.1|CF317255
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|89197079|gb|CI021919.1|CI021919
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTCGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|87029567|gb|CI257362.1|CI257362
EST:     GCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: GCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|29671336|gb|CB667611.1|CB667611
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|86423836|gb|CI062597.1|CI062597
EST:     CCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|86430902|gb|CI083325.1|CI083325
EST:     TTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: TTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|87022031|gb|CI259103.1|CI259103
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|58693866|gb|CK082553.1|CK082553
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|86414451|gb|CI068854.1|CI068854
EST:     ACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: ACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|33688396|gb|CF316635.1|CF316635
EST:     GATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: GATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|29614437|gb|CB619450.1|CB619450
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|89186154|gb|CI048023.1|CI048023
EST:     AGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: AGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|396941316|gb|HO188525.1|HO188525
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|86492246|gb|CI134879.1|CI134879
EST:     AGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: AGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|88991040|gb|CI108427.1|CI108427
EST:     TGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: TGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|33808856|gb|CF330313.1|CF330313
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|88839970|gb|CI079424.1|CI079424
EST:     TTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: TTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|33810826|gb|CF331304.1|CF331304
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGACGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|87018984|gb|CI256869.1|CI256869
EST:     TTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGTTCTTGATGTTGGC
genomic: TTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
EST: gi|117247218|gb|CT848558.1|CT848558
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTC
EST: gi|88847778|gb|CI018469.1|CI018469
EST:     CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAG                         ACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC
genomic: CTACCGATGTTGTAGTGGCTGACAAGTTTGCCGCAGATGCTGAAAGCAAGgtttgttcat ... tcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGC


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ttattacaaacttttatgtccgttgttttgatgtccactataccatcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGCCCAGATGCCATCAAGACTTCCAGCGAAGCATTGGACACCTGCAACACTA
                         ttttgat  putative branch site (score: 4)
                                             tcattttc  putative PPT
       aaacttttat  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
tgtggatggcaacatccagtaatattcatggtgcatagtactaaattattacaaacttttatgtccgttgttttgatgtccactataccatcattttcagACTGTTGCTGCCTCCGCTATCCCCGATGGTTGGATGGGTCTTGATGTTGGCCCAGATGCCATCAAGACTTCCAGCGAAGCATTGGACACCTGCAACACTA

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAGATG