Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...tatagcatgttcaggaacccttgtgttgacagcagtgatattcataaaagtagctgcttgtagactaacttgataccccttgtaaatcttggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGCGCATCTTCCATGGAGTAAAGCTTGATCGGGACGGAGCATATTGTTTTGC

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os01g73160.1
intron # 4
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os01g73160.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: GRMZM2G446960_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 4
----tatagcatgttcaggaaccctt-gtgttgacagcagtgatatt-cataaaagtagctgcttgtagactaacttgataccccttgtaaatcttggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGCGCATCTTCCATGGAGTAAAGCTTGATCGGGACGGAGCATATTGTTTTGC
    | |      | || |  |  |  |||||        || || | ||   || |||| ||||||| ||| ||      ||   | | ||| |||  | ||||||||||||||||||||||||| || || || || || || ||||||| ||| | |||||||||||||| | |  | | |  ||   ||||||   ||   |
acaatctgtgcactgcaagtgcattcagtgttcttgctgctgctaatgcaggcaaatagc-gcttgtaaactgaca----gccatgtttcaattttgt-ttttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGCCGCGGTGGCGGCGGTGCTTTCGGTGCTGGTGGATCTTCCATGGAGTGATGTGTCAACATGAGCTAGCATAACATTCGTC
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|16753351|gb|BM037730.1|BM037730
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGTGCCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGG
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTG-GTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGG
EST: gi|88481117|gb|CI418388.1|CI418388
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCANCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|88476596|gb|CI413867.1|CI413867
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCACCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|88838789|gb|CI376327.1|CI376327
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         G-TAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|88964009|gb|CI032926.1|CI032926
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|25800605|gb|CA756566.1|CA756566
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|88489802|gb|CI427074.1|CI427074
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|88516474|gb|CI444128.1|CI444128
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|88522602|gb|CI449502.1|CI449502
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|33660783|gb|CF291750.1|CF291750
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGGTGGTGGCGCATTCGGGTGGTG
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGG-TGGTGGCGCATTCGG-TGGTG
EST: gi|33673990|gb|CF302229.1|CF302229
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|55435429|gb|CV730846.1|CV730846
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|33670984|gb|CF299223.1|CF299223
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|88457223|gb|CI531822.1|CI531822
EST:     CTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: CTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|431819|gb|D23348.1|D23348
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGG
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGG
EST: gi|88479683|gb|CI416954.1|CI416954
EST:     GGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: GGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|33660784|gb|CF291751.1|CF291751
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|88527454|gb|CI455614.1|CI455614
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|66918916|gb|CX105764.1|CX105764
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|33670983|gb|CF299222.1|CF299222
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTG
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTG
EST: gi|88472413|gb|CI409684.1|CI409684
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|86523561|gb|CI163767.1|CI163767
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|88481347|gb|CI418618.1|CI418618
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|86599738|gb|CI255900.1|CI255900
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|88284173|gb|CI405619.1|CI405619
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|88522503|gb|CI450269.1|CI450269
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|86536268|gb|CI176474.1|CI176474
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGTCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|33815880|gb|CF333787.1|CF333787
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|33659996|gb|CF290963.1|CF290963
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|88483483|gb|CI420754.1|CI420754
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTACCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|88438447|gb|CI541191.1|CI541191
EST:     TGGTGGCGAGAAGGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCANCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TGGTGGCGAGAA-GGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|88416879|gb|CI546158.1|CI546158
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|88480225|gb|CI417496.1|CI417496
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|27576060|gb|CA998754.1|CA998754
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTTCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
EST: gi|55435539|gb|CV730900.1|CV730900
EST:     TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGG                         GGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC
genomic: TTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGC

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 49 (upstream exon), 62 (downstream exon)
Score: 14

TGGTGACAGGGATGGTTACAGGGGTGGCCCACGTGGTGCTCCAGGTGATTTTGGTGGCGAGAAGGGTGGTGCTCCAGCTGAGTTCCAGCCATCTTTTAGGgtaagagctc ... ggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGCGCATCTTCCATGGAGTAAAGCTTGATCGGGACGGAGCATATTGTTTTGC




<











<


<











 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

aaaagtagctgcttgtagactaacttgataccccttgtaaatcttggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGCGCATCTTCCATGGAGTAAAGCTTGATCGGGACGGAGCATATTGTTTTGC
                                  ttgtaaat  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
tatagcatgttcaggaacccttgtgttgacagcagtgatattcataaaagtagctgcttgtagactaacttgataccccttgtaaatcttggatgttcagGGTAGCAGACCTGGCTTTGGTCGTGGCGGTGGTGGCGCATTCGGTGGTGGCGCATCTTCCATGGAGTAAAGCTTGATCGGGACGGAGCATATTGTTTTGC

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  CATGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GGAGCA
- - -catgttc
- - - - - - - - - - -tgtgttg
- - - - - - - - - - - - - - -cagcagt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - cataaaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gctgctt