1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gttggtcttggtacattctatattttgtttgacttggtgcacagtagctgcaatttaagttctgcaaatttggatgaacctatttgttgccagactgacagcacttaatgcacaattgcattcctttttctgtaacttttgctgaacaatacgataatgttgtagGGCATGTACAAGCCTCATTTGTCATGATACATGTGGTTCCGTAGCAAATGTTTTGCTTGGGTTATTGTGGGACTAAATGAACTGCTACGGATGAGGGTTT
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os01g53060.2 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTCTACCTGTCAACCACTATGAGCAAGTGAAACCTCTAGTATACCTTCAG GGCATGTACAAGCCTCATTTGTCATGATACATGTGGTTCCGTAGCAAATGTEST: gi|89193953|gb|CI018271.1|CI018271
genomic: TTCTACCTGTCAACCACTATGAGCAAGTGAAACCTCTAGTATACCTTCAGgttggtcttg ... aatgttgtagGGCATGTACAAGCCTCATTTGTCATGATACATGTGGTTCCGTAGCAAATGT
EST: TTGTACCTGTCAACCACTATGAGCAAGTGAAACCTCTAGTATACCTTCAG GGCATGTACAAGCCTCATTTGTCATGATACATGTGGTTCCGTAGCAAATGTEST: gi|88442514|gb|CI544081.1|CI544081
genomic: TTCTACCTGTCAACCACTATGAGCAAGTGAAACCTCTAGTATACCTTCAGgttggtcttg ... aatgttgtagGGCATGTACAAGCCTCATTTGTCATGATACATGTGGTTCCGTAGCAAATGT
EST: GCAAGTGAAACCTCTAGTATACCTTCAG GGCATGTACAAGCCTCATTTGTCATGATACATGTGGTTCCGTAGCAAATGTEST: gi|38478947|gb|CF963080.1|CF963080
genomic: GCAAGTGAAACCTCTAGTATACCTTCAGgttggtcttg ... aatgttgtagGGCATGTACAAGCCTCATTTGTCATGATACATGTGGTTCCGTAGCAAATGT
EST: TTCTACCTGTCAACCACTATGAGCAAGTGAAACCTCTAGTATACCTTCAG GGCATGTACAAGCCTCATTTGTCATGATACATGTGGTTCCGTAGCAAATGTEST: gi|88233529|gb|CI233378.1|CI233378
genomic: TTCTACCTGTCAACCACTATGAGCAAGTGAAACCTCTAGTATACCTTCAGgttggtcttg ... aatgttgtagGGCATGTACAAGCCTCATTTGTCATGATACATGTGGTTCCGTAGCAAATGT
EST: TTCTACCTGTCAACCACTATGAGCAAGTGAAACCTCTAGTATACCTTCAG GGCATGTACAAGCCTCATTTGTCATGATACATGTGGTTCCGTAGCAAATGT
genomic: TTCTACCTGTCAACCACTATGAGCAAGTGAAACCTCTAGTATACCTTCAGgttggtcttg ... aatgttgtagGGCATGTACAAGCCTCATTTGTCATGATACATGTGGTTCCGTAGCAAATGT
cacaattgcattcctttttctgtaacttttgctgaacaatacgataatgttgtagGGCATGTACAAGCCTCATTTGTCATGATACATGTGGTTCCGTAGCAAATGTTTTGCTTGGGTTATTGTGGGACTAAATGAACTGCTACGGATGAGGGTTT
ctgtaac putative branch site (score: 6)
taactttt TA-rich tract