1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtgagtttaagtacataggctggctatgacaattgacaaacaagttttcctacaaataatcaaaggaactgatcattgacttacaacagGTTGGGTTGCTGAATGTGGACGGTTACTATGATCCGTTGCTTGCGCTATTTGATAAGGGTGCGGCAGAAGGATTTATTAAGGCCGATTGCAGACAAATAA
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os01g51210.2 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AGTTGTTAGAGATGATAACTTGGTCACAACTTGGAATTCATGACAAACCA GTTGGGTTGCTGAATGTGGACGGTTACTATGATCCGTTGCTTGCGCTATTTEST: gi|9865848|gb|AU101598.1|AU101598
genomic: AGTTGTTAGAGATGATAACTTGGTCACAACTTGGAATTCATGACAAACCAgtgagtttaa ... cttacaacagGTTGGGTTGCTGAATGTGGACGGTTACTATGATCCGTTGCTTGCGCTATTT
EST: AGTTGTTAGAGATGATAACTTGGTCACAACTTGGAATTCATGACAAACCA GTTGGGTTGCTGAATGTGGACGGTTACTATGATCCGTTGCTTGCGCTATTTEST: gi|86543341|gb|CI183547.1|CI183547
genomic: AGTTGTTAGAGATGATAACTTGGTCACAACTTGGAATTCATGACAAACCAgtgagtttaa ... cttacaacagGTTGGGTTGCTGAATGTGGACGGTTACTATGATCCGTTGCTTGCGCTATTT
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gacaaacaagttttcctacaaataatcaaaggaactgatcattgacttacaacagGTTGGGTTGCTGAATGTGGACGGTTACTATGATCCGTTGCTTGCGCTATTTGATAAGGGTGCGGCAGAAGGATTTATTAAGGCCGATTGCAGACAAATAA
gacttac putative branch site (score: 2)
tacaaataatcaaa TA-rich tract