1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtaaccataagttttaacctgatgtggaatacttgtttcagttcttttcgtagctgctgttcaccttcacaatttctgcagacttcagagtgctatatgcttctattttatgtgtaacaagtacttttatgggcatttgcagGAGTTGATATGCTTATGAAGGCTGCTGGAAAAGACTCGACCGCTCTGTTCAGTATCCTTCTATTATTATTGTTCAAACATACTTTTAAAGTTGCCTGCTG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os07g12830.2 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AGGTGGTGTGTACAACATTG-T-CGTACATGAAATTTCATCCGGGAG GAGTTGATATGCTTATGAAGGCTGCTGGAAAAGACTCGACCGCTCTGTTCA
genomic: AGGTCGTGTGTACAACATTGCTCCGTACATGAAATTTCATCCGGGAGgtaaccataa ... gcatttgcagGAGTTGATATGCTTATGAAGGCTGCTGGAAAAGACTCGACCGCTCTGTTCA
gagtgctatatgcttctattttatgtgtaacaagtacttttatgggcatttgcagGAGTTGATATGCTTATGAAGGCTGCTGGAAAAGACTCGACCGCTCTGTTCAGTATCCTTCTATTATTATTGTTCAAACATACTTTTAAAGTTGCCTGCTG
gtgtaac putative branch site (score: 28)
tattttatgtgtaa TA-rich tract