1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtatgcagatttttgcatacctgaaatttctgcagtttgtcttctttttaacataccacaaactggagctatatccgcatcatattgagcatttatcctcagtttaattggttctttttccctttttctgctgccagGTCAACTGCGTTGTCATGCGTGGAATGAATGATGACGAGATCTGTGATTTTGTTGAAATGACGAGAGACAAGCCTGTCAATGTCAGATTTATAGAGTTTA
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os02g15870.4 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CATGGAATCGATAGATGCTTCTATACAACTTGGGATTCCAATCTGTCAAG GTCNACTGCGTTGTCATGCGTGGAATGAATGATEST: gi|33654217|gb|CF276831.1|CF276831
genomic: CATGGAATCGATAGATGCTTCTATACAACTTGG-ATTCCAATCTGTCAAGgtatgcagat ... ctgctgccagGTCAACTGCGTTGTCATGCGTGGAATGAATGAT
EST: TCATGGAATCGATAGATGCTTCTATACAACTTGGATTCCAATCTGTCAAG GTCAACTGCGTTGTCATGCGTGGAATGAATGATGACGAGATCTGTGATTTT
genomic: TCATGGAATCGATAGATGCTTCTATACAACTTGGATTCCAATCTGTCAAGgtatgcagat ... ctgctgccagGTCAACTGCGTTGTCATGCGTGGAATGAATGATGACGAGATCTGTGATTTT
tattgagcatttatcctcagtttaattggttctttttccctttttctgctgccagGTCAACTGCGTTGTCATGCGTGGAATGAATGATGACGAGATCTGTGATTTTGTTGAAATGACGAGAGACAAGCCTGTCAATGTCAGATTTATAGAGTTTA
gtttaat putative branch site (score: 4)
ttggttctttttccct CT-rich tract
agtttaatt TA-rich tract