1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gtaagtatggtcaagtgggtatcgttgtgttctccttgttagcaatttgtgatctaatcttgtttctgcctaacagAGTGAGGAAGCAGCTATTGCTGCTTTGAAGAGATCATTGGGTGCCCTCAACACACACCTTGCATCAAACACATACCTTGTTGGCCATTCAGTGACTCTTG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os02g12800.3 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AATGGCTCTTCCCACGTCTTGGATTTGCTCCTTATGTTGCTGTC AGTGAGGAAGCAGCTATTGCTGCTTTGAAGAGATCATTGGGTGCCCTCAACEST: gi|88991494|gb|CI034829.1|CI034829
genomic: AATGGCTCTTCCCACGTCTTGGATTTGCTCCTTATGTTGCTGTCgtaagtatgg ... tgcctaacagAGTGAGGAAGCAGCTATTGCTGCTTTGAAGAGATCATTGGGTGCCCTCAAC
EST: CTGGAAAATGGCTCTTCCCACGTCTTGGATTTGCTCCTTATGTTGCTGTC AGTGAGGAAGCAGCTATTGCTGCTTTGAAGAGATCATTGGGTGCCCTCAACEST: gi|58601569|gb|CK012097.1|CK012097
genomic: CTGGAAAATGGCTCTTCCCACGTCTTGGATTTGCTCCTTATGTTGCTGTCgtaagtatgg ... tgcctaacagAGTGAGGAAGCAGCTATTGCTGCTTTGAAGAGATCATTGGGTGCCCTCAAC
EST: CTGGAAAATGGCTCTTCCCACGGCTTGGATTTGCTCCTTATGTTGCTGTC AGTGAGGAAGCAGCTATTGCTGCTTTGAAGAGATCATTGGGEST: gi|58691659|gb|CK080346.1|CK080346
genomic: CTGGAAAATGGCTCTTCCCACGTCTTGGATTTGCTCCTTATGTTGCTGTCgtaagtatgg ... tgcctaacagAGTGAGGAAGCAGCTATTGCTGCTTTGAAGAGATCATTGGG
EST: CTGGAAAATGGCTCTTCCCACGGCTTGGATTTGCTCCTTATGTTGCTGTC AGTGAGGAAGCAGCTATTGCTGCTTTGAAGAGATCATTGGGTGCCCTCAACEST: gi|58663459|gb|CK052145.1|CK052145
genomic: CTGGAAAATGGCTCTTCCCACGTCTTGGATTTGCTCCTTATGTTGCTGTCgtaagtatgg ... tgcctaacagAGTGAGGAAGCAGCTATTGCTGCTTTGAAGAGATCATTGGGTGCCCTCAAC
EST: CTGGAAAATGGCTCTTCCCACGGCTTGGATTTGCTCCTTATGTTGCTGTC AGTGAGGAAGCAGCTATTGCTGCTTTGAAGAGATCATTGGGTGCCCTCAAC
genomic: CTGGAAAATGGCTCTTCCCACGTCTTGGATTTGCTCCTTATGTTGCTGTCgtaagtatgg ... tgcctaacagAGTGAGGAAGCAGCTATTGCTGCTTTGAAGAGATCATTGGGTGCCCTCAAC
tcgttgtgttctccttgttagcaatttgtgatctaatcttgtttctgcctaacagAGTGAGGAAGCAGCTATTGCTGCTTTGAAGAGATCATTGGGTGCCCTCAACACACACCTTGCATCAAACACATACCTTGTTGGCCATTCAGTGACTCTTG
atctaat putative branch site (score: 3)
tcttgtttctgcct CT-rich tract
aatttgt TA-rich tract