Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtatgccattggatgatagctgttaacagttaatttttgttattgttgaactagacaacagctcttgtattcctctgatctatttgtgtgcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTGCTTTGCCGGAAGGTGGTGTTCTACTCCTAGAGAATGTTAGATTCTACA

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os02g07260.3
intron # 3
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os02g07260.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G382914_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 3
gtatgccattggatgatagctgttaacagttaatttttg-ttattgttgaactagacaacagctcttgtattcctctgatctatttgtgtgcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTGCTTTGCCGGAAGGTGGTGTTCTACTCCTAGAGAATGTTAGATTCTACA
                    || ||| | || |  || | ||||| | | ||  | | |    ||   |||||         || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
-----------------gtatgctaagatttgacattagcttattttagtacctg-ctatctttcagttattctaagtgctaatatgtgtgcataaatagGTCGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTCGAGAAGTTGGCTGCCGCTTTGCCAGAAGGTGGAGTTCTGCTCCTAGAGAATGTTAGATTCTACA
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|55415451|gb|CV727827.1|CV727827
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|568023|gb|D38858.1|D38858
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTG-ATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|58675077|gb|CK063764.1|CK063764
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33678660|gb|CF306899.1|CF306899
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|5607383|gb|AU076055.1|AU076055
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAAGGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33685914|gb|CF314153.1|CF314153
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGG-GAANGGAAGTTGAGAAATTGGCTG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGA--GGAAGTTGAGAAATTGGCTG
EST: gi|88404579|gb|CI581015.1|CI581015
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33794558|gb|CF323166.1|CF323166
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGNAGGGAAGTTGAGAAATTGGCTG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTG-AGG-AAGTTGAGAAATTGGCTG
EST: gi|2428603|gb|C73066.1|C73066
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATGGGTGATGAAGTNGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|2312269|gb|C28424.1|C28424
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATT-CATTGGTGAGGAAGTTGAGAA-TTGGNTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|58605824|gb|CK033857.1|CK033857
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|55828140|gb|AU062401.3|AU062401
EST:     ACAGCTTNAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTNGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTTGTGAGGAANTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|88313299|gb|CI594929.1|CI594929
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGA
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGA
EST: gi|33683766|gb|CF312005.1|CF312005
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|86847457|gb|CI287027.1|CI287027
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTG
EST: gi|33681699|gb|CF309938.1|CF309938
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33653529|gb|CF276143.1|CF276143
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|88576813|gb|CI673339.1|CI673339
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTG
EST: gi|33810824|gb|CF331303.1|CF331303
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|13806339|gb|AU181481.1|AU181481
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33794797|gb|CF323278.1|CF323278
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|4879073|gb|AU063372.1|AU063372
EST:     ACAGNTTGAAGCCTCTTGTTCCACGNTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTTGGTGAGG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATT-GGTGAGG
EST: gi|33807223|gb|CF329492.1|CF329492
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|29676664|gb|CB672939.1|CB672939
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33691128|gb|CF319367.1|CF319367
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|300216018|gb|HO088644.1|HO088644
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|163918048|gb|EG713148.1|EG713148
EST:     GAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: GAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33688397|gb|CF316636.1|CF316636
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|29614437|gb|CB619450.1|CB619450
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33797454|gb|CF324587.1|CF324587
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33685001|gb|CF313240.1|CF313240
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|86891986|gb|CI310119.1|CI310119
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|86883915|gb|CI309172.1|CI309172
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|86891927|gb|CI310089.1|CI310089
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|2310338|gb|C26493.1|C26493
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTNTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTNATGGCCAATNATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|86891797|gb|CI310024.1|CI310024
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|88433298|gb|CI591738.1|CI591738
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGACAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGA
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGA
EST: gi|33691112|gb|CF319351.1|CF319351
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33793275|gb|CF322518.1|CF322518
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGC
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTG-AGGAAGTTGAGAAATTGGCTGC
EST: gi|33692725|gb|CF320964.1|CF320964
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|88360362|gb|CI612081.1|CI612081
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|88412240|gb|CI573516.1|CI573516
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33694068|gb|CF322307.1|CF322307
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTG
EST: gi|88406489|gb|CI598982.1|CI598982
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGGCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|2428357|gb|C72820.1|C72820
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGC
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGG-TGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGC
EST: gi|14713602|gb|AU197588.1|AU197588
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|58667980|gb|CK056666.1|CK056666
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33691537|gb|CF319776.1|CF319776
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGNANGGAAGTTGAGAAATTGGCTG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTG-A-GGAAGTTGAGAAATTGGCTG
EST: gi|33688698|gb|CF316937.1|CF316937
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|29656155|gb|CB652430.1|CB652430
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33679657|gb|CF307896.1|CF307896
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGANGGAAGTTGAGAAATTGGCTGC
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGA-GGAAGTTGAGAAATTGGCTGC
EST: gi|29656603|gb|CB652878.1|CB652878
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|14574908|gb|AU197198.1|AU197198
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33692729|gb|CF320968.1|CF320968
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|13904803|gb|BF889441.1|BF889441
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33690563|gb|CF318802.1|CF318802
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33691338|gb|CF319577.1|CF319577
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|88390235|gb|CI605688.1|CI605688
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTG
EST: gi|33679751|gb|CF307990.1|CF307990
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGGGAGGGAAGTTGAGAAATTGGCTGC
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGG-AAGTTGAGAAATTGGCTGC
EST: gi|86821952|gb|CI309337.1|CI309337
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|163917828|gb|EG713114.1|EG713114
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|88430272|gb|CI567291.1|CI567291
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGC-TTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGG-TGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|32947941|gb|BP184513.1|BP184513
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33656001|gb|CF278615.1|CF278615
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33686118|gb|CF314357.1|CF314357
EST:     CAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTAGTAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGG-GNAGGGAAGTTGAGAAATTGGCT
genomic: CAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGG-AGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTG-AGG-AAGTTGAGAAATTGGCT
EST: gi|33688855|gb|CF317094.1|CF317094
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|88404607|gb|CI581043.1|CI581043
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33654156|gb|CF276770.1|CF276770
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTCGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGG-GAANGGAAGTTGAGAAATTGGCTG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGA--GGAAGTTGAGAAATTGGCTG
EST: gi|4879092|gb|AU063391.1|AU063391
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTNGAGTCGAT                         GTTGTGATGGC-AATGATT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATT
EST: gi|33804383|gb|CF328066.1|CF328066
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|27554028|gb|CA997928.1|CA997928
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|88313311|gb|CI594941.1|CI594941
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGG
EST: gi|88370659|gb|CI590237.1|CI590237
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGACAAATTGGCTGTT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|33808854|gb|CF330312.1|CF330312
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|4878615|gb|AU062914.1|AU062914
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTNATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|88357534|gb|CI623588.1|CI623588
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAG
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAG
EST: gi|117247218|gb|CT848558.1|CT848558
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: gi|3090437|gb|C93426.1|C93426
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGNTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTTATGGCCAATGATTGCATTNGTGAGGAAGTTGAGAAATT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATT
EST: gi|33688760|gb|CF316999.1|CF316999
EST:     ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT                         GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

gttgaactagacaacagctcttgtattcctctgatctatttgtgtgcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTGCTTTGCCGGAAGGTGGTGTTCTACTCCTAGAGAATGTTAGATTCTACA
                            ctctgat  putative branch site (score: 4)
                                               ataaata  TA-rich tract