Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...tttaatgtcatctgccgtatgttgcttgccgataagaaattgtgctaatatggagatttatgcacttgaccataacatctcatccttgttaacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTGTTGCTAGCAGTAACTG

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os10g37420.2
intron # 2
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os10g37420.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 2
lower sequence: GRMZM2G074169_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 1
-tttaatgtcatctgccgtatgttgcttgccgataagaaattgtgctaatatggag--atttatgcacttgaccataacatctcatccttgttaacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTGTTGCTAGCAGTAACTG
  || || | || |    ||  |           || ||||  |   ||| |   |  |||| |   |       |   ||||| |   | |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||
tgtttattttat-taatatac-tcataaaaatggaataaatcattgaaattttctgtcatttgttttccaatatgtgttatctc-tttctattaacatttcagGTGTATGATGTCACTCCTTTTATGGATGAGCATCCTGGTGGAGATGAGGTTTTGCTAGCTGTAACTG
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|88586707|gb|CI703481.1|CI703481
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88691401|gb|CI733479.1|CI733479
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|86532760|gb|CI172966.1|CI172966
EST:     CTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: CTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88381730|gb|CI682402.1|CI682402
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88440898|gb|CI693473.1|CI693473
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88342486|gb|CI646008.1|CI646008
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|95100980|gb|CI692706.1|CI692706
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88574597|gb|CI666366.1|CI666366
EST:     TGGCCGGCCACAANGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTCTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|25800242|gb|CA756203.1|CA756203
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88591238|gb|CI708160.1|CI708160
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88375488|gb|CI681261.1|CI681261
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|8528169|gb|AU092984.1|AU092984
EST:     GGCCGGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: GGCC-GGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88311056|gb|CI657969.1|CI657969
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88577707|gb|CI674307.1|CI674307
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88334546|gb|CI676324.1|CI676324
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88337196|gb|CI628282.1|CI628282
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88442885|gb|CI694293.1|CI694293
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88569967|gb|CI661142.1|CI661142
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88359938|gb|CI679707.1|CI679707
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88405239|gb|CI685698.1|CI685698
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88690083|gb|CI734162.1|CI734162
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88328987|gb|CI658635.1|CI658635
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88326641|gb|CI658362.1|CI658362
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88345809|gb|CI631077.1|CI631077
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88290595|gb|CI666968.1|CI666968
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88307882|gb|CI646317.1|CI646317
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88386815|gb|CI629142.1|CI629142
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|89171272|gb|CI040549.1|CI040549
EST:     GCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: GCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88349378|gb|CI678365.1|CI678365
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|218490862|gb|FG966653.1|FG966653
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88583772|gb|CI701278.1|CI701278
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88355956|gb|CI653366.1|CI653366
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTCCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88352784|gb|CI678808.1|CI678808
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88208150|gb|CI207999.1|CI207999
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88305481|gb|CI630643.1|CI630643
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTACTGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGT
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTA-TGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGT
EST: gi|88388706|gb|CI683493.1|CI683493
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88397631|gb|CI684563.1|CI684563
EST:     TGGCCGGCCACAANGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88689314|gb|CI732890.1|CI732890
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88585372|gb|CI703000.1|CI703000
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|8527889|gb|AU092704.1|AU092704
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88524332|gb|CI452232.1|CI452232
EST:     CATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: CATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88432949|gb|CI690807.1|CI690807
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88959395|gb|CI685876.1|CI685876
EST:     TGGNCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|86531953|gb|CI172159.1|CI172159
EST:     TTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88903836|gb|CI711538.1|CI711538
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88309656|gb|CI656397.1|CI656397
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88306232|gb|CI636617.1|CI636617
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88590277|gb|CI709117.1|CI709117
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88339281|gb|CI633852.1|CI633852
EST:     GGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCCGGGAAG                         GTATATGATGTCACTTCTTTTATGGATGAACACCCTGGTGGCGATGAAGT
genomic: GGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCC-GGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGT
EST: gi|88593059|gb|CI711209.1|CI711209
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88451879|gb|CI694654.1|CI694654
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88327214|gb|CI652255.1|CI652255
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGCTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|87029900|gb|CI267913.1|CI267913
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|38468823|gb|CF952954.1|CF952954
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88451907|gb|CI694684.1|CI694684
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|38472222|gb|CF956353.1|CF956353
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATAAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88347130|gb|CI631210.1|CI631210
EST:     TGGCCGGNCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88571609|gb|CI662982.1|CI662982
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|95101553|gb|CI697072.1|CI697072
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88592568|gb|CI710679.1|CI710679
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88412691|gb|CI690444.1|CI690444
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88585936|gb|CI703610.1|CI703610
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88992876|gb|CI035838.1|CI035838
EST:     ATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: ATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88578078|gb|CI674709.1|CI674709
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88579937|gb|CI691934.1|CI691934
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88691767|gb|CI733344.1|CI733344
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88688652|gb|CI732228.1|CI732228
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88588918|gb|CI706765.1|CI706765
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|58587258|gb|CF985566.1|CF985566
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88347028|gb|CI628698.1|CI628698
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|325494547|gb|JG459071.1|JG459071
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAG
EST: gi|163929023|gb|EG711985.1|EG711985
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88584368|gb|CI701916.1|CI701916
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88590146|gb|CI708976.1|CI708976
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88353914|gb|CI634705.1|CI634705
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88591896|gb|CI709956.1|CI709956
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88300895|gb|CI592075.1|CI592075
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88432959|gb|CI690817.1|CI690817
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|2312329|gb|C28484.1|C28484
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88412529|gb|CI690265.1|CI690265
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88588716|gb|CI706553.1|CI706553
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88375262|gb|CI681022.1|CI681022
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88584367|gb|CI701915.1|CI701915
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88382836|gb|CI682730.1|CI682730
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88588247|gb|CI706051.1|CI706051
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88365494|gb|CI680135.1|CI680135
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88306423|gb|CI638208.1|CI638208
EST:     GGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGT
genomic: GGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCC-GGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGT
EST: gi|88592785|gb|CI710912.1|CI710912
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88429170|gb|CI690058.1|CI690058
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88303265|gb|CI668913.1|CI668913
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|325494067|gb|JG458591.1|JG458591
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAG
EST: gi|88307932|gb|CI646367.1|CI646367
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88720517|gb|CI743816.1|CI743816
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88305397|gb|CI630559.1|CI630559
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88468815|gb|CI696813.1|CI696813
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88371855|gb|CI681362.1|CI681362
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|3759935|gb|C97193.1|C97193
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88718030|gb|CI741540.1|CI741540
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88326807|gb|CI675511.1|CI675511
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88355406|gb|CI679121.1|CI679121
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|88213312|gb|CI213161.1|CI213161
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
EST: gi|95101596|gb|CI697116.1|CI697116
EST:     TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAG                         GTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG
genomic: TGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTG

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 67 (upstream exon), 70 (downstream exon)
Score: 96

GTGGGCGGCGGACATGGCCGGCGAGAAGAAGGTGTTCGGGTTCGAGGAGGTGGCCGGCCACAACGTCACCAAGGATTGCTGGCTCATCATCGCCGGGAAGgttttttttt ... aacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTGTTGCTAGCAGTAACTG




<











<


<











 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

taatatggagatttatgcacttgaccataacatctcatccttgttaacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTGTTGCTAGCAGTAACTG
                                         tgttaac  putative branch site (score: 96)
                                           ttaacattt  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
tttaatgtcatctgccgtatgttgcttgccgataagaaattgtgctaatatggagatttatgcacttgaccataacatctcatccttgttaacatttcagGTATATGATGTTACTTCTTTTATGGATGAGCACCCTGGTGGCGATGAAGTGTTGCTAGCAGTAACTG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  TGGTGG
- - - - catctgc
- - - - - - - - - - - tgcttgc
- - - - - - - - - - - - - - - gataagaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - attgtgc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ttatgca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - accataa