1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtaagtgcttcctaactgtcccctgcctccatactgaatgactgttaatctgttatgacatcaattgtgaaatgtaatctagGTAACTGGTAAGGCTGTTATGCTGGATGAGATAATTAACTATGTTCAATCATTACAGAGGCAGGTTGAGGTATGATGTTTGTAAAACTTGTAGGGCCATT
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os06g16400.3 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCAGTGAAAGGATGAAATATCTTCAGGATCTTGTTCCTGGTTGTAGTACA GTACCTGGTAAGGCTGTTATGCTGGATGAGATAATTAACTATGTTCAATCA
genomic: TCAGTGAAAGGATGAAATATCTTCAGGATCTTGTTCCTGGTTGTAGTAAAgtaagtgctt ... tgtaatctagGTAACTGGTAAGGCTGTTATGCTGGATGAGATAATTAACTATGTTCAATCA
tccatactgaatgactgttaatctgttatgacatcaattgtgaaatgtaatctagGTAACTGGTAAGGCTGTTATGCTGGATGAGATAATTAACTATGTTCAATCATTACAGAGGCAGGTTGAGGTATGATGTTTGTAAAACTTGTAGGGCCATT
tgttaat putative branch site (score: 3)
aaatgtaat TA-rich tract