1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtatgccattggatgatagctgttaacagttaatttttgttattgttgaactagacaacagctcttgtattcctctgatctatttgtgtgcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTGCTTTGCCGGAAGGTGGTGTTCTACTCCTAGAGAATGTTAGATTCTACA
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os02g07260.2 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGNAGGGAAGTTGAGAAATTGGCTGEST: gi|58675077|gb|CK063764.1|CK063764
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTG-AGG-AAGTTGAGAAATTGGCTG
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|88362801|gb|CI614157.1|CI614157
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: A-AGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTATGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGEST: gi|33678660|gb|CF306899.1|CF306899
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAG
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|58605824|gb|CK033857.1|CK033857
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|29656603|gb|CB652878.1|CB652878
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|14574908|gb|AU197198.1|AU197198
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|13806339|gb|AU181481.1|AU181481
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|33794797|gb|CF323278.1|CF323278
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|58667980|gb|CK056666.1|CK056666
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|33690674|gb|CF318913.1|CF318913
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|300216018|gb|HO088644.1|HO088644
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|163918048|gb|EG713148.1|EG713148
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: GAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|13904803|gb|BF889441.1|BF889441
genomic: GAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|2310338|gb|C26493.1|C26493
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTNTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTNATGGCCAATNATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|29676664|gb|CB672939.1|CB672939
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|33793275|gb|CF322518.1|CF322518
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCEST: gi|33797454|gb|CF324587.1|CF324587
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTG-AGGAAGTTGAGAAATTGGCTGC
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|29686925|gb|CB683200.1|CB683200
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|163917828|gb|EG713114.1|EG713114
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|32947941|gb|BP184513.1|BP184513
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|29656155|gb|CB652430.1|CB652430
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|29614437|gb|CB619450.1|CB619450
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|27554028|gb|CA997928.1|CA997928
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|4878615|gb|AU062914.1|AU062914
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTNATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTEST: gi|117247218|gb|CT848558.1|CT848558
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
EST: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGAT GTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
genomic: ACAGCTTGAAGCCTCTTGTTCCACGCTTGTCTGAGCTACTTGGAGTCGATgtatgccatt ... gcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCT
gttgaactagacaacagctcttgtattcctctgatctatttgtgtgcataaatagGTTGTGATGGCCAATGATTGCATTGGTGAGGAAGTTGAGAAATTGGCTGCTGCTTTGCCGGAAGGTGGTGTTCTACTCCTAGAGAATGTTAGATTCTACA
ctctgat putative branch site (score: 4)
ataaata TA-rich tract