1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
...ctgaattaatatttgcttcacagtgttatttactgctccatactgtgcctttctcttgctgttaatctttttttttctttttacctaaatgctaatgcagGACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGCTAGTCTCTGAAAACCAG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os01g73910.4 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGCGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAG GACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGCEST: gi|88688286|gb|CI731862.1|CI731862
genomic: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAGgtcaccacca ... gctaatgcagGACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGC
EST: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAG GACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTEST: gi|2427812|gb|C72275.1|C72275
genomic: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAGgtcaccacca ... gctaatgcagGACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGT
EST: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAG GACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGCEST: gi|88411775|gb|CI571267.1|CI571267
genomic: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAGgtcaccacca ... gctaatgcagGACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGC
EST: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAG GACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGCEST: gi|88664563|gb|CI699578.1|CI699578
genomic: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAGgtcaccacca ... gctaatgcagGACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGC
EST: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAG GACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGCEST: gi|13806000|gb|AU181304.1|AU181304
genomic: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAGgtcaccacca ... gctaatgcagGACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGC
EST: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAG GACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGCEST: gi|88762070|gb|CI771626.1|CI771626
genomic: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAGgtcaccacca ... gctaatgcagGACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGC
EST: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAG GACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGCEST: gi|58591227|gb|CF989535.1|CF989535
genomic: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAGgtcaccacca ... gctaatgcagGACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGC
EST: GCTGCTGAGAGCAGTTCCACGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAG GACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGCEST: gi|88312036|gb|CI580201.1|CI580201
genomic: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAGgtcaccacca ... gctaatgcagGACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGC
EST: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGGTTTGCTAG GACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGCEST: gi|29683738|gb|CB680013.1|CB680013
genomic: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAGgtcaccacca ... gctaatgcagGACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGC
EST: GCTGCTGAGAGCAATTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAA GACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGCEST: gi|88454163|gb|CI694086.1|CI694086
genomic: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAGgtcaccacca ... gctaatgcagGACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGC
EST: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAG GACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGCEST: gi|13806135|gb|AU181375.1|AU181375
genomic: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAGgtcaccacca ... gctaatgcagGACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGC
EST: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAG GACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGCEST: gi|88689580|gb|CI733156.1|CI733156
genomic: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAGgtcaccacca ... gctaatgcagGACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGC
EST: GNTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAG GAACAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTG
genomic: GCTGCTGAGAGCAGTTCCAGGGCTTAATGATATGGGCAAGGCTTTGCTAGgtcaccacca ... gctaatgcagGACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTG
tgcctttctcttgctgttaatctttttttttctttttacctaaatgctaatgcagGACCAGTTTCTGAGCAAGTTATGGTACTTCAGAACATTGGATCGTCTGTGCTAGTCTCTGAAAACCAG
tgctaat putative branch site (score: 2)
ttaatctttttttttc TA-rich tract