1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtatttgcttgttctattttcgttcagtattaagtagagagcacattttctatgctgtgaaccactttctatgctgtgaaccacatctgaatcgtttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACCGGAATGTCACTGCACAAACTCTTAAGGCTATCCCTCTTATTACAAAGA
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os01g33050.2 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|163922774|gb|EG714200.1|EG714200
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|88211308|gb|CI210948.1|CI210948
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGAAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|7332432|gb|AU085778.1|AU085778
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|88211757|gb|CI211397.1|CI211397
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|29623609|gb|CB628620.1|CB628620
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|10930713|gb|AU160987.1|AU160987
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|2311654|gb|C27809.1|C27809
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|570064|gb|D40913.1|D40913
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|29623610|gb|CB628621.1|CB628621
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|88211049|gb|CI212482.1|CI212482
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|112786041|gb|EE591935.1|EE591935
genomic: TGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|88207577|gb|CI207426.1|CI207426
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|88519409|gb|CI447063.1|CI447063
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: ATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAAGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|86846996|gb|CI283111.1|CI283111
genomic: ATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|88204566|gb|CI204415.1|CI204415
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|66922755|gb|CX109603.1|CX109603
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAN GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|33655746|gb|CF278360.1|CF278360
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACTTGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|88533740|gb|CI460401.1|CI460401
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: GGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|86429814|gb|CI082237.1|CI082237
genomic: GGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|88575427|gb|CI669572.1|CI669572
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAAGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|87013684|gb|CI269183.1|CI269183
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|86898729|gb|CI296052.1|CI296052
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|88305091|gb|CI652025.1|CI652025
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|86529842|gb|CI170048.1|CI170048
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|88506783|gb|CI434289.1|CI434289
genomic: TGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: GATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAAGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|218494325|gb|FG952804.1|FG952804
genomic: GATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGEST: gi|86496271|gb|CI138904.1|CI138904
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAG
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|88212040|gb|CI211680.1|CI211680
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|218478137|gb|FG953400.1|FG953400
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|87012006|gb|CI283893.1|CI283893
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: CAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|109711930|gb|CI029100.1|CI029100
genomic: CAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|86531584|gb|CI171790.1|CI171790
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TAAATGGACATAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|86601348|gb|CI251722.1|CI251722
genomic: TAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|27546707|gb|CA764976.2|CA764976
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: GACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCCGAGCGCTATGACEST: gi|88289503|gb|CI555865.1|CI555865
genomic: GACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: GGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|33677090|gb|CF305329.1|CF305329
genomic: GGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAATTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|33659897|gb|CF290864.1|CF290864
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|218494965|gb|FG965712.1|FG965712
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACEST: gi|8859884|gb|AU097202.1|AU097202
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
EST: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAG GACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
genomic: TTAAATGGACAAAAGCATACAGATGCTTGCATGGGAAGGACATGACGCAGgtatttgctt ... ttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGAC
tatgctgtgaaccactttctatgctgtgaaccacatctgaatcgtttgaaatcagGACTCCACCTTTGAGTTTGAGAGGAAGAGGAACAGACCAGAGCGCTATGACCGGAATGTCACTGCACAAACTCTTAAGGCTATCCCTCTTATTACAAAGA
tttgaaat TA-rich tract