1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtgtttaaggatcccgtgctatctcgttttataggcgaatacttgctgggaatatgttaaatttgatgatgatgtacttctcgcagataaaatgctatgtgcagCAGCTATTGTCAGGGCTTGAGCATTGCCACAATAATAATGTATTGCATCGGGATATCAAGGGATCAAACTTATTGTTGGATAACAATGGGATTCTTAAGA
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os01g27020.2 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ACCTTGCTGGCCTGGCAGCGAGCCCGGACGTCAAGTTTACTCTGCCGCAG CAGCTATTGTCAGGGCTTGAGCATTGCCACAATAATAATGTATTGCATCGG
genomic: ACCTTGCTGGCCTGGCAGCGAGCCCGGACGTCAAGTTTACTCTGCCGCAGgtgtttaagg ... ctatgtgcagCAGCTATTGTCAGGGCTTGAGCATTGCCACAATAATAATGTATTGCATCGG
gaatatgttaaatttgatgatgatgtacttctcgcagataaaatgctatgtgcagCAGCTATTGTCAGGGCTTGAGCATTGCCACAATAATAATGTATTGCATCGGGATATCAAGGGATCAAACTTATTGTTGGATAACAATGGGATTCTTAAGA
atttgat putative branch site (score: 1)
ttaaatttgatgat TA-rich tract