1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' | 18 5' 3' | 19 5' 3' | 20 5' 3' |
21 5' 3' |
gtaagctgtcttcatatatgcccttggggtagcacgattattatttagaacttggattaactaatatactactgttttaattttttaacagATGTTTTGGTGGTGAAGTACTCGAAGGATATGGAATGACAGAGACATCATGTATCATCTCTGCAATGAATATTGGTGATAGGTTAATTGGTCATGTCGGA
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os12g04990.3 |
intron # | 14 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ACTTCAGGCGCTTCTCCATTGTCAGCTGATGTAATGGAATTCCTAAGAAT ATGTTTTGGTGGTGAAGTACTCGAAGGATATGGAATGACAGAGACATCATGEST: gi|58602340|gb|CK012868.1|CK012868
genomic: ACTTCAGGCGCTTCTCCATTGTCAGCTGATGTAATGGAATTCCTAAGAATgtaagctgtc ... tttttaacagATGTTTTGGTGGTGAAGTACTCGAAGGATATGGAATGACAGAGACATCATG
EST: ACTTCAGGCGCTTCTCCATTGTCAGCTGATGTAATGGAATTCCTAAGAAT ATGTTTTGGTGGTGAAGTACTCGAAGGATATGGAATGACAGAGACATCATGEST: gi|58693358|gb|CK082045.1|CK082045
genomic: ACTTCAGGCGCTTCTCCATTGTCAGCTGATGTAATGGAATTCCTAAGAATgtaagctgtc ... tttttaacagATGTTTTGGTGGTGAAGTACTCGAAGGATATGGAATGACAGAGACATCATG
EST: ACTTCAGGCGCTTCTCCATTGTCAGCTGATGTAATGGAATTCCTAAGAAT ATGTTTTGGTGGTGAAGTACTCGAAGGATATGGAATGACAGAGACATCATGEST: gi|58659745|gb|CK048425.1|CK048425
genomic: ACTTCAGGCGCTTCTCCATTGTCAGCTGATGTAATGGAATTCCTAAGAATgtaagctgtc ... tttttaacagATGTTTTGGTGGTGAAGTACTCGAAGGATATGGAATGACAGAGACATCATG
EST: ACTTCAGGCGCTTCTCCATTGTCAGCTGATGTAATGGAATTCCTAAGAAT ATGTTTTGGGGGTGAAGTACTCGAAGGATATGGAATGACAGAGACATCATG
genomic: ACTTCAGGCGCTTCTCCATTGTCAGCTGATGTAATGGAATTCCTAAGAATgtaagctgtc ... tttttaacagATGTTTTGGTGGTGAAGTACTCGAAGGATATGGAATGACAGAGACATCATG
attattatttagaacttggattaactaatatactactgttttaattttttaacagATGTTTTGGTGGTGAAGTACTCGAAGGATATGGAATGACAGAGACATCATGTATCATCTCTGCAATGAATATTGGTGATAGGTTAATTGGTCATGTCGGA
tttttt CT-rich tract
attaactaatatacta TA-rich tract