1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' |
gtaacaccttcattcatgaggtccttaggtgcaaatcccagtgaagaataatcagttctactttgtatggttcatctcgcttactgaccggttcatctcgggatcaattacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATTCAGGTGTATCCGTCGCTGATGGCCTCTCCAATCTGCTGAAG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os01g08700.4 |
intron # | 14 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29678222|gb|CB674497.1|CB674497
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|86479924|gb|CI122557.1|CI122557
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: ATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|88727803|gb|CI749605.1|CI749605
genomic: ATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: TTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|33794177|gb|CF322979.1|CF322979
genomic: TTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGEST: gi|86873316|gb|CI341541.1|CI341541
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAG
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|218500614|gb|FG963936.1|FG963936
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29661464|gb|CB657739.1|CB657739
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29640970|gb|CB645977.1|CB645977
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|33684724|gb|CF312963.1|CF312963
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|38473887|gb|CF958019.1|CF958019
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|87014839|gb|CI271438.1|CI271438
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|396941313|gb|HO188522.1|HO188522
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29640969|gb|CB645976.1|CB645976
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|86884433|gb|CI337001.1|CI337001
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29660971|gb|CB657246.1|CB657246
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|8956369|gb|BE230188.1|BE230188
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29666879|gb|CB663154.1|CB663154
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|58694532|gb|CK083219.1|CK083219
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|87013961|gb|CI271352.1|CI271352
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: ACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|38481214|gb|CF965303.1|CF965303
genomic: ACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29659878|gb|CB656153.1|CB656153
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: TTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|38475264|gb|CF959397.1|CF959397
genomic: TTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29662457|gb|CB658732.1|CB658732
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|86872020|gb|CI333181.1|CI333181
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29640400|gb|CB645409.1|CB645409
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|86437083|gb|CI118805.1|CI118805
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: TTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|38475517|gb|CF959650.1|CF959650
genomic: TTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGG-AGGGTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29655772|gb|CB652047.1|CB652047
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29657251|gb|CB653526.1|CB653526
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|86478281|gb|CI120914.1|CI120914
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: TGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|88273155|gb|CI388611.1|CI388611
genomic: TGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|33381935|gb|CF197278.1|CF197278
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29665790|gb|CB662065.1|CB662065
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: TGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACCAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAEST: gi|86481276|gb|CI123909.1|CI123909
genomic: TGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCA-CAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGA
EST: GATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|86599150|gb|CI355767.1|CI355767
genomic: GATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG GEST: gi|86599150|gb|CI355767.1|CI355767
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcag-
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG GEST: gi|33796653|gb|CF324194.1|CF324194
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcag-
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|33796911|gb|CF324319.1|CF324319
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29666878|gb|CB663153.1|CB663153
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|569793|gb|D40642.1|D40642
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29658234|gb|CB654509.1|CB654509
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29656547|gb|CB652822.1|CB652822
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29656546|gb|CB652821.1|CB652821
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|38472171|gb|CF956302.1|CF956302
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29661493|gb|CB657768.1|CB657768
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29672499|gb|CB668774.1|CB668774
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29645728|gb|CB650735.1|CB650735
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29623545|gb|CB628556.1|CB628556
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|86885526|gb|CI318677.1|CI318677
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGACCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29657666|gb|CB653941.1|CB653941
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|87041499|gb|CI196121.1|CI196121
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: TTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|88724061|gb|CI749071.1|CI749071
genomic: TTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29657062|gb|CB653337.1|CB653337
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|396941595|gb|HO188252.1|HO188252
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29677022|gb|CB673297.1|CB673297
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29636462|gb|CB641471.1|CB641471
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|58688124|gb|CK076811.1|CK076811
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: TGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTANTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|29639165|gb|CB644174.1|CB644174
genomic: TGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTGCCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTTATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|8335255|gb|BE040239.1|BE040239
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATEST: gi|86860507|gb|CI323433.1|CI323433
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
EST: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAG CTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
genomic: CTGATGGAATGCTTGTTGATGGTGAAGCTTGTACTTTACCACAATTAGAGgtaacacctt ... ttacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGAT
ttgtatggttcatctcgcttactgaccggttcatctcgggatcaattacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATTCAGGTGTATCCGTCGCTGATGGCCTCTCCAATCTGCTGAAG
tactgac putative branch site (score: 1)
atcaatta TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| gtaacaccttcattcatgaggtccttaggtgcaaatcccagtgaagaataatcagttctactttgtatggttcatctcgcttactgaccggttcatctcgggatcaattacgagcagCTATTGGAAGTAACCGCCAGAGCAGTCCATCTCATCGTCGAATGGGGAGATTCAGGTGTATCCGTCGCTGATGGCCTCTCCAATCTGCTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CTGAAG