1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' |
gtacatactgtttaaggttgtattcaaattagccatatcggtttgccagcgtaataatcttgtgacctgtttatatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAAAACGTGCTGGCTGGGGTGTGATGACCAGTCACAGGAG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os03g14450.1 |
intron # | 13 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|8527321|gb|AU092136.1|AU092136
genomic: GCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|86429290|gb|CI075971.1|CI075971
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|89197132|gb|CI051862.1|CI051862
genomic: GCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: TCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|88845546|gb|CI084471.1|CI084471
genomic: TCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: CAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|287175|gb|D15980.1|D15980
genomic: CAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|86260061|gb|CI065934.1|CI065934
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|86525380|gb|CI165586.1|CI165586
genomic: GCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|86538875|gb|CI179081.1|CI179081
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|88219213|gb|CI220486.1|CI220486
genomic: GGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|33810065|gb|CF330920.1|CF330920
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: TAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|86878119|gb|CI340660.1|CI340660
genomic: TAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: TGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|86852115|gb|CI317860.1|CI317860
genomic: TGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: CAAGGCCGGCAATGCTCTTCTCCTTAAG G-TAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|88829394|gb|CI074264.1|CI074264
genomic: CAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|89184182|gb|CI046747.1|CI046747
genomic: GCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|86413406|gb|CI067811.1|CI067811
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|89184015|gb|CI046580.1|CI046580
genomic: GCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: CTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|27576854|gb|CA999548.1|CA999548
genomic: CTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|88836429|gb|CI078326.1|CI078326
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|86430946|gb|CI083369.1|CI083369
genomic: GCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|86854613|gb|CI258906.1|CI258906
genomic: GCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|88839949|gb|CI079403.1|CI079403
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|5900716|gb|AU078371.1|AU078371
genomic: GCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|25799533|gb|CA755494.1|CA755494
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATGGGATCTGTTATTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|29678594|gb|CB674869.1|CB674869
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|88829973|gb|CI074645.1|CI074645
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: CAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|9864951|gb|AU100701.1|AU100701
genomic: CAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|88849664|gb|CI089770.1|CI089770
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: ACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|8528267|gb|AU093082.1|AU093082
genomic: ACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|86852543|gb|CI320468.1|CI320468
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: ACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTTTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATCTCAEST: gi|89195154|gb|CI051267.1|CI051267
genomic: ACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: ATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|88974238|gb|CI019911.1|CI019911
genomic: ATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|86535052|gb|CI175258.1|CI175258
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|86430895|gb|CI083318.1|CI083318
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGACGTCAEST: gi|87024296|gb|CI257037.1|CI257037
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|88841649|gb|CI080905.1|CI080905
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|89184770|gb|CI048326.1|CI048326
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|86251762|gb|CI018954.1|CI018954
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|33810063|gb|CF330919.1|CF330919
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|88837682|gb|CI079042.1|CI079042
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: CAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|86435388|gb|CI106621.1|CI106621
genomic: CAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAGTTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|88837558|gb|CI078918.1|CI078918
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: AGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|86415101|gb|CI069504.1|CI069504
genomic: AGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|88840605|gb|CI080059.1|CI080059
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: AGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATGGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|89197240|gb|CI051970.1|CI051970
genomic: AGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|88262264|gb|CI365840.1|CI365840
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: TAAGGACAAGGCC-GCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATT-GATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|5455544|gb|AU075759.1|AU075759
genomic: TAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|89175061|gb|CI041139.1|CI041139
genomic: GGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|218503770|gb|FG954179.1|FG954179
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|88511459|gb|CI438965.1|CI438965
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: CAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|568037|gb|D38872.1|D38872
genomic: CAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|86436429|gb|CI118151.1|CI118151
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|86594831|gb|CI258085.1|CI258085
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|88262265|gb|CI365841.1|CI365841
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: CAAGCCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|88837559|gb|CI078919.1|CI078919
genomic: CAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: CAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATGGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|88840060|gb|CI079514.1|CI079514
genomic: CAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: AGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|89189347|gb|CI048886.1|CI048886
genomic: AGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: AGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|86413328|gb|CI067733.1|CI067733
genomic: AGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|325493849|gb|JG458373.1|JG458373
genomic: GGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAATGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|88837587|gb|CI078947.1|CI078947
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: TTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAEST: gi|8528193|gb|AU093008.1|AU093008
genomic: TTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
EST: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAG GTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
genomic: GGGTAGCCAAGGCAATTAAGGACAAGGCCTGCAATGCTCTTCTCCTTAAGgtacatactg ... tatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCA
ttagccatatcggtttgccagcgtaataatcttgtgacctgtttatatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAAAACGTGCTGGCTGGGGTGTGATGACCAGTCACAGGAG
taataatctt TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| gtacatactgtttaaggttgtattcaaattagccatatcggtttgccagcgtaataatcttgtgacctgtttatatggtttagGTTAACCAAATTGGATCTGTTACTGAGAGCATTGAGGCTGTCAAGATGTCAAAACGTGCTGGCTGGGGTGTGATGACCAGTCACAGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGATG