Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...aattgcttaacagcaacaaagaattcattttaaatggacttatgcaagatatgaacacattgaaatattctcatacattcttcgaattattaattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTACCTAATTATTCTCTTCAGTTTCCTAGTAATCACTACACGG

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os08g01180.1
intron # 12
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os08g01180.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 12
lower sequence: GRMZM2G021784_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 12
-----aattgcttaacagcaacaaagaattcattttaaatggacttatgcaagata--tgaacacattgaaatattctcatacattcttcgaattattaattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTACCTAATTATTCTCTTCAGTTTCCTAGTAATCACTACACGG
     | |    |     ||   |      | |||||  ||  ||| ||  | ||       ||  |||| |   ||||| |||  |     |||||| |  ||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| || |||||||||
agggtattcagatttggtcattcagtgccactttttagttgtgcttttgagacatcaccaggcaggttgagactatctcacacagcc-----attattgaccca--gGTTGCAGGTGTTACTTTTGATCTGCTGTTCCTTCTGGTGCTCGGCTCCTACCTGATTGTTCTCTTCTGTTTCCTAGTGATTACTACACGG

upper sequence: LOC_Os08g01180.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 12
lower sequence: GRMZM2G451366_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 12
aattgcttaacagcaacaaagaattcattttaaatggacttatgcaagatatgaacacattgaaata----ttctcatacattcttcgaattattaattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTACCTAATTATTCTCTTCAGTTTCCTAGTAATCACTACACGG
                   |    |   |    |    | ||||     | ||  ||  || || |     || | | ||| | | || ||    | | | ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| | || |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||
-----------------gtacgtctgggtgaccacaagcctatgggcattttgttcatgtttaagttgtgcttttgagacactat-cggatcgaaattactcagGTTGCAAGTGTTACCTTTGATCTGCTGTTCCTTCTGGTGCTGGGTTCCTACCTGATCGTTCTCTTCTGTTTCCTAGTAATCAGTACACGG
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|88957695|gb|CI095469.1|CI095469
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|86841489|gb|CI336466.1|CI336466
EST:     CAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCT-GTGATTGGCTCCTAC
genomic: CAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|88840257|gb|CI079711.1|CI079711
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTAAATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|88996814|gb|CI389480.1|CI389480
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|86427164|gb|CI072261.1|CI072261
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|89164718|gb|CI101806.1|CI101806
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|86854636|gb|CI258929.1|CI258929
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|88849067|gb|CI087589.1|CI087589
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|3760363|gb|C97617.1|C97617
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|218494749|gb|FG957718.1|FG957718
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|109712838|gb|CI105446.1|CI105446
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|89179920|gb|CI044199.1|CI044199
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCGACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|86485064|gb|CI127697.1|CI127697
EST:     TTCTATGATGCAACCAAGGCAACTCTGAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: TTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|86844858|gb|CI337741.1|CI337741
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|86486989|gb|CI129622.1|CI129622
EST:     AAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: AAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|86484742|gb|CI127375.1|CI127375
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|88251510|gb|CI349938.1|CI349938
EST:     AATGTATATCAG                         GTTCGCAAATGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATT-GCTCCTA
genomic: AATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTT-GCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTA
EST: gi|88835730|gb|CI370835.1|CI370835
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|88962033|gb|CI097186.1|CI097186
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|11233402|gb|AU164814.1|AU164814
EST:     GGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|86854626|gb|CI258919.1|CI258919
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|86489415|gb|CI132048.1|CI132048
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|86432595|gb|CI086206.1|CI086206
EST:     GCATGTTCACGTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|86425157|gb|CI070254.1|CI070254
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACGAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|29626679|gb|CB631690.1|CB631690
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|86840128|gb|CI332752.1|CI332752
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|29627355|gb|CB632366.1|CB632366
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|86487055|gb|CI129688.1|CI129688
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|89195954|gb|CI395372.1|CI395372
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|88956010|gb|CI092298.1|CI092298
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|58662499|gb|CK051185.1|CK051185
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|88846566|gb|CI373334.1|CI373334
EST:     ATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: ATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|86535737|gb|CI175943.1|CI175943
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCTACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|29613550|gb|CB618563.1|CB618563
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|86887659|gb|CI311942.1|CI311942
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|86483664|gb|CI126297.1|CI126297
EST:     GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
EST: gi|87017996|gb|CI275810.1|CI275810
EST:     GCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAG                         GTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC
genomic: GCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTAC

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 64 (upstream exon), 70 (downstream exon)
Score: 33

ACTATCTGAGCACACTGCTGATGTCCACGTTCAAAGCGATGTTCTTGATGGCATGTTCACTTTCTATGATGCAACAAAGGCAACTCTAAATGTATATCAGgtaagtgttt ... taattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTACCTAATTATTCTCTTCAGTTTCCTAGTAATCACTACACGG




<











<


<











 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

aagatatgaacacattgaaatattctcatacattcttcgaattattaattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTACCTAATTATTCTCTTCAGTTTCCTAGTAATCACTACACGG
                                          tattaat  putative branch site (score: 33)
                                   ttcgaattattaatt  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
aattgcttaacagcaacaaagaattcattttaaatggacttatgcaagatatgaacacattgaaatattctcatacattcttcgaattattaattcacagGTTGCAAGTGTTACTTTTGATTTACTGTTCCTTCTGGTGATTGGCTCCTACCTAATTATTCTCTTCAGTTTCCTAGTAATCACTACACGG

- -tgcttaa
- - - - - - -caacaaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ttatgca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gaacaca