Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtatgcatatcttctcaagacttatactgacaggtttaagcatatccttactgaagctttctttgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCGCAAG

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os05g03480.4
intron # 11
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os05g03480.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 11
lower sequence: GRMZM2G381051_T03 (Zea mays), 3'ss of exon 11
gtatgcatatcttctcaagacttatactgacaggtttaagcatatccttactgaagctttctttgttgt-ttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCGCAAG
   |       | ||||| | || | || ||| |||||| ||| |  |   |  |  ||  ||| ||   | || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||
--gtaggatcttgctcaatatttttccttacaagtttaaacatcttatcggtacaatttcattttttccatcagATCATTTGTATACTCAGTTGCTAGGGACTGCGATAATGGCAAAGTTGATCGCAAG

upper sequence: LOC_Os05g03480.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 11
lower sequence: GRMZM2G052630_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 10
gtatgcatatcttctcaagacttatactgacaggtttaagcatatccttactgaagctttctttgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCGCAAG
   |       | ||||| | || | || ||| |||||  ||| |  | |||  | |||  ||| |   | || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||
--gtaagaccttgctcaatattt-tccttacaagtttagacatcttatcactacaacttcatttttccatcagATCATTTGTATACTCGGTTGCTAGGGACTGCGATAATGGCAAAGTTGATCGCAAG

upper sequence: LOC_Os05g03480.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 11
lower sequence: AT3G45300.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 12
gtatgcatatcttctcaagactt---atactgacaggttta----agcatatccttactgaagc----tttctttgttgt-ttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCGCAAG
|||   |  |  |||||| |||    | | |     ||  |    |   || |   |   ||      || |||||   | | |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||
gtagaaaacttctctcaatactctggaaattattttgtccatagaaatgtagctcaagcaaaaagttgttcctttggcatatcagGTCATACGTTTACTCTGTTGCGAGGGACTGTGACAATGGGAAAGTTGACCCAAAG

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|86428807|gb|CI075488.1|CI075488
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|15855456|gb|BI808268.1|BI808268
EST:     GAAATT-GCAGATATGTACACCTCCTT-CAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACCATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29661230|gb|CB657505.1|CB657505
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|89193724|gb|CI116357.1|CI116357
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29680250|gb|CB676525.1|CB676525
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|86259889|gb|CI065762.1|CI065762
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|18386365|gb|BM419563.1|BM419563
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGAC-ATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|86592394|gb|CI251048.1|CI251048
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29672430|gb|CB668705.1|CB668705
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29668356|gb|CB664631.1|CB664631
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29674357|gb|CB670632.1|CB670632
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|33683927|gb|CF312166.1|CF312166
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|86428674|gb|CI075355.1|CI075355
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|89184274|gb|CI046839.1|CI046839
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|86823798|gb|CI258824.1|CI258824
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|18387595|gb|BM420793.1|BM420793
EST:     CCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTA-GGACTGTGAC-ATGGTAAAGTTGACCG
genomic: CCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|88471675|gb|CI408946.1|CI408946
EST:     TTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: TTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29644599|gb|CB649606.1|CB649606
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29643546|gb|CB648553.1|CB648553
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|86488039|gb|CI130672.1|CI130672
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29663209|gb|CB659484.1|CB659484
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29637531|gb|CB642540.1|CB642540
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29673823|gb|CB670098.1|CB670098
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29641739|gb|CB646746.1|CB646746
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|86252415|gb|CI056152.1|CI056152
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|22307242|gb|BQ908464.1|BQ908464
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|87026900|gb|CI259553.1|CI259553
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|16753672|gb|BM038051.1|BM038051
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTT-CAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACCATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29663217|gb|CB659492.1|CB659492
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|86429655|gb|CI076336.1|CI076336
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29657681|gb|CB653956.1|CB653956
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29669234|gb|CB665509.1|CB665509
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29674434|gb|CB670709.1|CB670709
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACCCCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGAGTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29670747|gb|CB667022.1|CB667022
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|22306117|gb|BQ907339.1|BQ907339
EST:     GGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACCATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|86259763|gb|CI065636.1|CI065636
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29672136|gb|CB668411.1|CB668411
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29674356|gb|CB670631.1|CB670631
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTANGGACTGTGACAATGGT
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGT
EST: gi|29675357|gb|CB671632.1|CB671632
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|88253465|gb|CI352091.1|CI352091
EST:     TGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: TGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29683358|gb|CB679633.1|CB679633
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29664111|gb|CB660386.1|CB660386
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|22307122|gb|BQ908344.1|BQ908344
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACACATGGTAAAGTTGACC
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACA-ATGGTAAAGTTGACC
EST: gi|88834472|gb|CI077755.1|CI077755
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|88485441|gb|CI422712.1|CI422712
EST:     GCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|55440359|gb|CV733489.1|CV733489
EST:     ACAGGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: ACAGGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29637681|gb|CB642690.1|CB642690
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGTCCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29672648|gb|CB668923.1|CB668923
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29667481|gb|CB663756.1|CB663756
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGCCCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|88837225|gb|CI078585.1|CI078585
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|86412887|gb|CI067292.1|CI067292
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|58594804|gb|CF993112.1|CF993112
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|22306512|gb|BQ907734.1|BQ907734
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29642661|gb|CB647668.1|CB647668
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29642659|gb|CB647666.1|CB647666
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|86425023|gb|CI070120.1|CI070120
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|55440357|gb|CV733488.1|CV733488
EST:     GGTTTTTTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|33677636|gb|CF305875.1|CF305875
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29680932|gb|CB677207.1|CB677207
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|89173649|gb|CI041542.1|CI041542
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29664257|gb|CB660532.1|CB660532
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|33683926|gb|CF312165.1|CF312165
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|18386948|gb|BM420146.1|BM420146
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|428577|gb|D24729.1|D24729
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTATGACANTGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29665695|gb|CB661970.1|CB661970
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29661040|gb|CB657315.1|CB657315
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29679285|gb|CB675560.1|CB675560
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|86866433|gb|CI343411.1|CI343411
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTCCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACC
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTT-GCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACC
EST: gi|29664204|gb|CB660479.1|CB660479
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|18386397|gb|BM419595.1|BM419595
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29663798|gb|CB660073.1|CB660073
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|88828952|gb|CI073822.1|CI073822
EST:     ATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: ATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29637680|gb|CB642689.1|CB642689
EST:     GGGAAATTGGCATATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GGCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29671621|gb|CB667896.1|CB667896
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|86260123|gb|CI065996.1|CI065996
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|86486584|gb|CI129217.1|CI129217
EST:     CTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: CTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|88990521|gb|CI107908.1|CI107908
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|218479296|gb|FG957919.1|FG957919
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTCAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29678948|gb|CB675223.1|CB675223
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29669119|gb|CB665394.1|CB665394
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29661172|gb|CB657447.1|CB657447
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29680495|gb|CB676770.1|CB676770
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|86488910|gb|CI131543.1|CI131543
EST:     ACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: ACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29658318|gb|CB654593.1|CB654593
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|89184088|gb|CI046653.1|CI046653
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|18386437|gb|BM419635.1|BM419635
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|86436256|gb|CI117978.1|CI117978
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|88993293|gb|CI257721.1|CI257721
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|88831435|gb|CI083829.1|CI083829
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|86536936|gb|CI177142.1|CI177142
EST:     CCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: CCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|89185669|gb|CI047538.1|CI047538
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
EST: gi|29661525|gb|CB657800.1|CB657800
EST:     GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG                         GTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG
genomic: GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCG

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 45 (upstream exon), 75 (downstream exon)
Score: 34

GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGgtatgcatat ... tgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCGCAAG




<











<


<











 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

gacttatactgacaggtttaagcatatccttactgaagctttctttgttgtttagGTCATTTGTTTACTCGGTTGCTAGGGACTGTGACAATGGTAAAGTTGACCGCAAG
                                      ctttctttgttgttt  CT-rich tract
                                       tttcttt  TA-rich tract