1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' |
gtatgctgattcttctgtgaacaagcagtctttatcatactgttcacctcctgcccatttgccctatttctgtagctctagtttttgtattagtataacagctaaccacattacactttgtgttgtagGTGGAGCTTTATGCAGAGTATGAGCCAAGGATGCTAATACCCTTCCTCCGTACCAGTCAGCATTACAGGCTTGACAAG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os04g11880.3 |
intron # | 11 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTCTGTTTGAGACAGACATGAATGCTGGAAAAGACTATCATGACATGCAG GTGGAGCTTTATGCAGAGTATGAGCCAAGGATGCTAATACCCTTCCTCCGTEST: gi|58692342|gb|CK081029.1|CK081029
genomic: CTCTGTTTGAGACAGACATGAATGCTGGAAAAGACTATCATGACATGCAGgtatgctgat ... tgtgttgtagGTGGAGCTTTATGCAGAGTATGAGCCAAGGATGCTAATACCCTTCCTCCGT
EST: CTCTGTTTGAGACAGACATGAATGCTGGAAAAGACTATCATGACATGCAG GTGGAGCTTTATGCAGAGTATGAGCCAAGGATGCTAATACCCTTCCTCCGT
genomic: CTCTGTTTGAGACAGACATGAATGCTGGAAAAGACTATCATGACATGCAGgtatgctgat ... tgtgttgtagGTGGAGCTTTATGCAGAGTATGAGCCAAGGATGCTAATACCCTTCCTCCGT
agctctagtttttgtattagtataacagctaaccacattacactttgtgttgtagGTGGAGCTTTATGCAGAGTATGAGCCAAGGATGCTAATACCCTTCCTCCGTACCAGTCAGCATTACAGGCTTGACAAG
agctaac putative branch site (score: 2)
tttttgtattagtata TA-rich tract