1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' |
gtatgtttctgatcttttggctatccctgcatgcaactctagcaatattttactatatcgatcccttacccttggtcccttgcagGTCACTTTATTTGGTTCCCTTGAAATGCCAAAGGCTGATATATGGGTTGTCATAGCAATCTTGTCGGGTGTGATTGGATATTGTGCTAAGATCTACTTCA
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os12g29550.1 |
intron # | 10 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TAACACCAATGGATTGGGTCAAGTTTCTTATTTCTGCTGTTATTGGTCTG GTCACTTTATTTGGTTCCCTTGAAATGCCAAAGGCTGATATATGGGTTGTC
genomic: TAACACCAATGGATTGGGTCAAGTTTCTTATTTCTGCTGTTATTGGTCTGgtatgtttct ... tcccttgcagGTCACTTTATTTGGTTCCCTTGAAATGCCAAAGGCTGATATATGGGTTGTC
atgcaactctagcaatattttactatatcgatcccttacccttggtcccttgcagGTCACTTTATTTGGTTCCCTTGAAATGCCAAAGGCTGATATATGGGTTGTCATAGCAATCTTGTCGGGTGTGATTGGATATTGTGCTAAGATCTACTTCA
cccttac putative branch site (score: 22)
tcccttgc putative PPT
aatattttactatat TA-rich tract