1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' |
gtatatccaggaaactcttacatatgtcctgttttatcctgtttctaggtgcaacattttgttaacagacgtctggtaccaaccataacaagttatcttttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os05g03480.4 |
intron # | 10 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29661230|gb|CB657505.1|CB657505
genomic: TCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|89193724|gb|CI116357.1|CI116357
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: CCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29680250|gb|CB676525.1|CB676525
genomic: CCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|86259889|gb|CI065762.1|CI065762
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|18386365|gb|BM419563.1|BM419563
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: CCAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCC-ATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|86592394|gb|CI251048.1|CI251048
genomic: CCAAAGAGAGCAA-TTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29672430|gb|CB668705.1|CB668705
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29668356|gb|CB664631.1|CB664631
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29674357|gb|CB670632.1|CB670632
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATCCAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|33683927|gb|CF312166.1|CF312166
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|86428674|gb|CI075355.1|CI075355
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|89184274|gb|CI046839.1|CI046839
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCCAAGAGAGCCATTTGGCCGTCCCATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|86823798|gb|CI258824.1|CI258824
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29644599|gb|CB649606.1|CB649606
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29643546|gb|CB648553.1|CB648553
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|86488039|gb|CI130672.1|CI130672
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: CGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29663209|gb|CB659484.1|CB659484
genomic: CGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29637531|gb|CB642540.1|CB642540
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29673823|gb|CB670098.1|CB670098
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29641739|gb|CB646746.1|CB646746
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGGGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|86252415|gb|CI056152.1|CI056152
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|22307242|gb|BQ908464.1|BQ908464
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: CCAAAGAGAGC-ATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACACG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|87026900|gb|CI259553.1|CI259553
genomic: CCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACA-Ggtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|16753672|gb|BM038051.1|BM038051
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GTGAATTCCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTT-CAGTCATCAAGEST: gi|29663217|gb|CB659492.1|CB659492
genomic: GTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|86429655|gb|CI076336.1|CI076336
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: TCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29657681|gb|CB653956.1|CB653956
genomic: TCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29669234|gb|CB665509.1|CB665509
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29674434|gb|CB670709.1|CB670709
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACCCCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29670747|gb|CB667022.1|CB667022
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|86259763|gb|CI065636.1|CI065636
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: CAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29672136|gb|CB668411.1|CB668411
genomic: CAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29674356|gb|CB670631.1|CB670631
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29675357|gb|CB671632.1|CB671632
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29683358|gb|CB679633.1|CB679633
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29664111|gb|CB660386.1|CB660386
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|22307122|gb|BQ908344.1|BQ908344
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCC-AAGAGAGCAATTT-GCCGTCC-ATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|88834472|gb|CI077755.1|CI077755
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: TGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29637681|gb|CB642690.1|CB642690
genomic: TGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATGCAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29672648|gb|CB668923.1|CB668923
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29667481|gb|CB663756.1|CB663756
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|88837225|gb|CI078585.1|CI078585
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: AATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|86412887|gb|CI067292.1|CI067292
genomic: AATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|58594804|gb|CF993112.1|CF993112
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|22306512|gb|BQ907734.1|BQ907734
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: CCCAAAGAGAGCAATTT-GCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29642661|gb|CB647668.1|CB647668
genomic: -CCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29642659|gb|CB647666.1|CB647666
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|86425023|gb|CI070120.1|CI070120
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: ATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|55440357|gb|CV733488.1|CV733488
genomic: ATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGTTTTTTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|33677636|gb|CF305875.1|CF305875
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29680932|gb|CB677207.1|CB677207
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|89173649|gb|CI041542.1|CI041542
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: TGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29664257|gb|CB660532.1|CB660532
genomic: TGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|33683926|gb|CF312165.1|CF312165
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|18386948|gb|BM420146.1|BM420146
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTT-GCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|428577|gb|D24729.1|D24729
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAANAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29665695|gb|CB661970.1|CB661970
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29661040|gb|CB657315.1|CB657315
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29679285|gb|CB675560.1|CB675560
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|86866433|gb|CI343411.1|CI343411
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTCCAGTCATCAAGEST: gi|29664204|gb|CB660479.1|CB660479
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|18386397|gb|BM419595.1|BM419595
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: CCGTCCAATTGGTGAATTTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29663798|gb|CB660073.1|CB660073
genomic: CCGTCCAATTGGTGAA-TTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|84117533|gb|CD151300.1|CD151300
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACEST: gi|29637680|gb|CB642689.1|CB642689
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTAC
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCATATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29671621|gb|CB667896.1|CB667896
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|86260123|gb|CI065996.1|CI065996
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|88990521|gb|CI107908.1|CI107908
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|218479296|gb|FG957919.1|FG957919
genomic: GTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29678948|gb|CB675223.1|CB675223
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29669119|gb|CB665394.1|CB665394
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29661172|gb|CB657447.1|CB657447
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29680495|gb|CB676770.1|CB676770
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29658318|gb|CB654593.1|CB654593
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|89184088|gb|CI046653.1|CI046653
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCCATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|18386437|gb|BM419635.1|BM419635
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|86436256|gb|CI117978.1|CI117978
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: AGAGAGCCATTTGCCCGTCCCATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|88993293|gb|CI257721.1|CI257721
genomic: AGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|88831435|gb|CI083829.1|CI083829
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|89185669|gb|CI047538.1|CI047538
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCCAAGAGAGCCATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAGEST: gi|29661525|gb|CB657800.1|CB657800
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
EST: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAG GGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
genomic: GCCAAAGAGAGCAATTTGGCCGTCCAATTGGTGAATTTCAGTTCATACAGgtatatccag ... tttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
acattttgttaacagacgtctggtaccaaccataacaagttatcttttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
ttatctttt CT-rich tract
aagttatcttttaat TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| gtatatccaggaaactcttacatatgtcctgttttatcctgtttctaggtgcaacattttgttaacagacgtctggtaccaaccataacaagttatcttttaatgcagGGGAAATTGGCAGATATGTACACCTCCTTGCAGTCATCAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAGAT