1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
gtatgatattattagtgttttggttgaaaatttctttcaaaaagaaaaaatgaatcaggagaaaagtttacattgagaaaattgagaaccatcaacgactttgcagGCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGAGGAATCGTCTGTGATCGTCACGTGTTCCGGATAATTCAGCACTGGCTCC
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os04g52500.1 |
intron # | 10 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAG GCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGAEST: gi|27576266|gb|CA998960.1|CA998960
genomic: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAGgtatgatatt ... gactttgcagGCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGA
EST: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAG GCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGAEST: gi|218500790|gb|FG960830.1|FG960830
genomic: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAGgtatgatatt ... gactttgcagGCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGA
EST: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAG GCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGAEST: gi|29614249|gb|CB619262.1|CB619262
genomic: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAGgtatgatatt ... gactttgcagGCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGA
EST: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAG GCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGAEST: gi|29627613|gb|CB632624.1|CB632624
genomic: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAGgtatgatatt ... gactttgcagGCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGA
EST: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAG GCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGAEST: gi|86493449|gb|CI136082.1|CI136082
genomic: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAGgtatgatatt ... gactttgcagGCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGA
EST: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAG GCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGAEST: gi|33799965|gb|CF325850.1|CF325850
genomic: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAGgtatgatatt ... gactttgcagGCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGA
EST: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAG GCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGAEST: gi|29614251|gb|CB619264.1|CB619264
genomic: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAGgtatgatatt ... gactttgcagGCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGA
EST: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAG GCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGAEST: gi|86500894|gb|CI143527.1|CI143527
genomic: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAGgtatgatatt ... gactttgcagGCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGA
EST: GATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAG GCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGAEST: gi|29645191|gb|CB650198.1|CB650198
genomic: GATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAGgtatgatatt ... gactttgcagGCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGA
EST: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAG GCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGAEST: gi|29629570|gb|CB634579.1|CB634579
genomic: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAGgtatgatatt ... gactttgcagGCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGA
EST: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAG GCAGATGGCCTGGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGAEST: gi|218497772|gb|FG957253.1|FG957253
genomic: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAGgtatgatatt ... gactttgcagGCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGA
EST: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAG GCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGAEST: gi|29644324|gb|CB649331.1|CB649331
genomic: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAGgtatgatatt ... gactttgcagGCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGA
EST: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAG GCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGAEST: gi|29614208|gb|CB619221.1|CB619221
genomic: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAGgtatgatatt ... gactttgcagGCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGA
EST: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAG GCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGAEST: gi|29665283|gb|CB661558.1|CB661558
genomic: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAGgtatgatatt ... gactttgcagGCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGA
EST: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAG GCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGA
genomic: ACTACATCTGTGTTGATGGTGATGGATCTGTCCCTGTAGAATCAGCAAAGgtatgatatt ... gactttgcagGCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGA
gaatcaggagaaaagtttacattgagaaaattgagaaccatcaacgactttgcagGCAGATGGCCTCGATGCAGTGGCAAGAGTTGGGGTTGCTGCAGACCACCGAGGAATCGTCTGTGATCGTCACGTGTTCCGGATAATTCAGCACTGGCTCC
aaaagttta TA-rich tract