1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtatgaattgaacacacatatacatgcagagtcaacttagtttgatgtttatcataatctcctcttggtcttatcttattctactggtttttaattagtagccttgtctgtctctccccttaaattttcagCTCTGCCAATCTCTTCCTTGTTCCCCTTCCTGTACTTCATG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os12g03860.7 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CATTCCCTACAGGGAGTTCCTCTTCGTTGCCATCACCACCCTCGCCTCCT CTCTGCCAATCTCTTCCTTGTTCCCCTTCCTGTACTTCATGAEST: gi|87008889|gb|CI304832.1|CI304832
genomic: CATTCCCTACAGGGAGTTCCTCTTCGTTGCCATCACCACCCTCGCCTCCTgtatgaattg ... aaattttcagCTCTGCCAATCTCTTCCTTGTTCCCCTTCCTGTACTTCATGA
EST: CATTCCCTACAGGGAGTTCCTCTTCGTTGCCATCACCACCCTCGCCTCCT CTCTGCCAATCTCTTCCTTGTTCCCCTTCCTGTACTTCATGEST: gi|33795182|gb|CF323464.1|CF323464
genomic: CATTCCCTACAGGGAGTTCCTCTTCGTTGCCATCACCACCCTCGCCTCCTgtatgaattg ... aaattttcagCTCTGCCAATCTCTTCCTTGTTCCCCTTCCTGTACTTCATG
EST: CATTCCCTACAGGGAGTTCCTCTTCGTTGCCATCACCACCCTCGCCTCCT CTCTGCCAATCTCTTCCTTGTTCCCCTTCCTGTACTTCATGEST: gi|88571513|gb|CI662886.1|CI662886
genomic: CATTCCCTACAGGGAGTTCCTCTTCGTTGCCATCACCACCCTCGCCTCCTgtatgaattg ... aaattttcagCTCTGCCAATCTCTTCCTTGTTCCCCTTCCTGTACTTCATG
EST: CATTCCCTACAGGGAGTTCCTCTTCGTTGCCATCACCACCCTCGCCTCCT CTCTGCCAATCTCTTCCTTGTTCCCCTTCCTGTACTTCATGEST: gi|88372054|gb|CI641689.1|CI641689
genomic: CATTCCCTACAGGGAGTTCCTCTTCGTTGCCATCACCACCCTCGCCTCCTgtatgaattg ... aaattttcagCTCTGCCAATCTCTTCCTTGTTCCCCTTCCTGTACTTCATG
EST: CATTCCCTACAGGGAGTTCCTCTTCGTTGCCATCACCACCCTCGCCTCCT CTCTGCCAATCTCTTCCTTGTTCCCCTTCCTGTACTTCATGEST: gi|88694564|gb|CI738602.1|CI738602
genomic: CATTCCCTACAGGGAGTTCCTCTTCGTTGCCATCACCACCCTCGCCTCCTgtatgaattg ... aaattttcagCTCTGCCAATCTCTTCCTTGTTCCCCTTCCTGTACTTCATG
EST: CATTCCCTACAGGGAGTTCCTCTTCGTTGCCATCACCACCCTCGCCTCCT CTCTGCCAATCTCTTCCTTGTTCCCCTTCCTGTACTTCATGEST: gi|33677540|gb|CF305779.1|CF305779
genomic: CATTCCCTACAGGGAGTTCCTCTTCGTTGCCATCACCACCCTCGCCTCCTgtatgaattg ... aaattttcagCTCTGCCAATCTCTTCCTTGTTCCCCTTCCTGTACTTCATG
EST: CATTCCCTACAGGGAGTTCCTCTTCGTTGCCATCACCACCCTCGCCTCCT CTCTGCCAATCTCTTCCTTGTTCCCCTTCCTGTACTTCATGEST: gi|88342532|gb|CI637108.1|CI637108
genomic: CATTCCCTACAGGGAGTTCCTCTTCGTTGCCATCACCACCCTCGCCTCCTgtatgaattg ... aaattttcagCTCTGCCAATCTCTTCCTTGTTCCCCTTCCTGTACTTCATG
EST: CATTCCCTACAGGGAGTTCCTCTTCGTTGCCATCACCACCCTCGCCTCCT CTCTGCCAATCTCTTCCTTGTTCCCCTTCCTGTACTTCATG
genomic: CATTCCCTACAGGGAGTTCCTCTTCGTTGCCATCACCACCCTCGCCTCCTgtatgaattg ... aaattttcagCTCTGCCAATCTCTTCCTTGTTCCCCTTCCTGTACTTCATG
tattctactggtttttaattagtagccttgtctgtctctccccttaaattttcagCTCTGCCAATCTCTTCCTTGTTCCCCTTCCTGTACTTCATG
ttttaat putative branch site (score: 3)
ccttgtctgtctctcc putative PPT
tttttaattagta TA-rich tract