1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtgagtacccctcgctctctccctacctaaaccctaatcgctctcctctcctcgcgattgattgctattgagagttttctgaggagggaattgggggggattggttccctgtttgccctgtgtgctcgttttgatcggagGTGAGCAGTGGCGGCGGTGGCGGACGGGATGAAGGCGTGGGGGGTGATGCGGGAGCGGGCGTACGCCTTCGACCTCGTGCTCACGGAGGTCACTATGCCC
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os11g05930.2 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTCCACCCGCCAGGTCGTCACCGCGCTCCTCCGCAAGTGCGGCTACCGCG -TG-GC-G-G-CGG---TGGCGGACGGGATGAAGGCGTGGGGGGTGATGCGEST: gi|33674795|gb|CF303034.1|CF303034
genomic: CTCCACCCGCCAGGTCGTCACCGCGCTCCTCCGCAAGTGCGGCTACCGCGgtgagtaccc ... ttgatcggagGTGAGCAGTGGCGGCGGTGGCGGACGGGATGAAGGCGTGGGGGGTGATGCG
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gggaattgggggggattggttccctgtttgccctgtgtgctcgttttgatcggagGTGAGCAGTGGCGGCGGTGGCGGACGGGATGAAGGCGTGGGGGGTGATGCGGGAGCGGGCGTACGCCTTCGACCTCGTGCTCACGGAGGTCACTATGCCC
ttttgat putative branch site (score: 4)
ctcgtttt CT-rich tract
ttttgat TA-rich tract