1 5' 3' | 2 5' 3' |
gtaagcttagctatttttcacgtgttgttcaatgtgcttttctgatgttagtatcactgaaaaccatctatcgtaagactgctttgacccgcttggcttaaccttaccttgtacatatcagATGTCCTTTACAGGTAAACCATATCTTACATGAAGGATCTGCTGCTTCCAATATCTTGAGTGCTGTCTTGGACTTAGGTGTGTTCATTTTCCTGCATATT
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os02g44599.4 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATGGTGGTATTGCAGGAACGGTTGTATTTGCTTCCCTGCAATGTTGACGG ATGTCCTTTACAGGTAAACCATATCTTACATGAAGGATCTGCTGCTTCCAAEST: gi|86482088|gb|CI124721.1|CI124721
genomic: ATGGTGGTATTGCAGGAACGGTTGTATTTGCTTCCCTGCAATGTTGACGGgtaagcttag ... tacatatcagATGTCCTTTACAGGTAAACCATATCTTACATGAAGGATCTGCTGCTTCCAA
EST: ATGGTGGTATTGCAGGAACGGTTGTATTTGCTTCCCTGCAATGTTGACGG ATGTCCTTTACAGGTAAACCATATCTTACATGAAGGATCTGCTGCTTCCAA
genomic: ATGGTGGTATTGCAGGAACGGTTGTATTTGCTTCCCTGCAATGTTGACGGgtaagcttag ... tacatatcagATGTCCTTTACAGGTAAACCATATCTTACATGAAGGATCTGCTGCTTCCAA
tctatcgtaagactgctttgacccgcttggcttaaccttaccttgtacatatcagATGTCCTTTACAGGTAAACCATATCTTACATGAAGGATCTGCTGCTTCCAATATCTTGAGTGCTGTCTTGGACTTAGGTGTGTTCATTTTCCTGCATATT
accttac putative branch site (score: 1)
tacatat TA-rich tract