Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...atttctgattttgagtatttttttaaaaaaagaatttgtggggatagttcgttcttggtgttcttgagtgatactaatagatgattctgtttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCTGTCTTACAGCTCCATGGCTCCAATCATCCTTAACCTCATCCAGTGGATG

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os01g67850.1
intron # 1
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os01g67850.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 1
lower sequence: GRMZM2G058450_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 1
----atttctgattttgagtatttttttaaaaaaagaatttgtggggatagttcgttcttggtgttc-ttgagtgatactaatagatgattctgtttgttttc-agGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCTGTCTTACAGCTCCATGGCTCCAATCATCCTTAACCTCATCCAGTGGATG
    |  | ||   ||  || ||   |     |  | ||| |    | | ||  |||||  | |||   |||   |||    || |     || | | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||
ggaaaagtttgccctttcgttttccgtccccgattgtattcg----gctcgt--gttctatgcgtttactgatgaatataggtaaaatcccctctctcttctccagGGCGCATGCTATACACAGGGCGTATGGGGGTGCCTGCGTGCAGATGAGGCTGTCCTACAGCTCCATGGCTCCAATCTTTCTCAACCTTATCCAATGGATG
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|88954924|gb|CI720287.1|CI720287
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88668763|gb|CI719720.1|CI719720
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|33677048|gb|CF305287.1|CF305287
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|33691279|gb|CF319518.1|CF319518
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAAGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88674310|gb|CI728423.1|CI728423
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88668758|gb|CI719715.1|CI719715
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|41884252|gb|BX929083.1|BX929083
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88673222|gb|CI725997.1|CI725997
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88689824|gb|CI731402.1|CI731402
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88955232|gb|CI721804.1|CI721804
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88741864|gb|CI764369.1|CI764369
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88674853|gb|CI728966.1|CI728966
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|33693004|gb|CF321243.1|CF321243
EST:     AGGGGCCCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCTTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88972350|gb|CI717091.1|CI717091
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88904756|gb|CI712055.1|CI712055
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|89171383|gb|CI720442.1|CI720442
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88594336|gb|CI714294.1|CI714294
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|33654303|gb|CF276917.1|CF276917
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88984135|gb|CI723691.1|CI723691
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88954667|gb|CI720184.1|CI720184
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88984094|gb|CI723653.1|CI723653
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88668010|gb|CI722749.1|CI722749
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88668506|gb|CI722068.1|CI722068
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88594835|gb|CI714793.1|CI714793
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88669957|gb|CI724073.1|CI724073
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88669286|gb|CI719424.1|CI719424
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88672393|gb|CI726509.1|CI726509
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88973413|gb|CI717849.1|CI717849
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88667964|gb|CI722703.1|CI722703
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88390114|gb|CI590627.1|CI590627
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88391425|gb|CI598243.1|CI598243
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|89171592|gb|CI720651.1|CI720651
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88676621|gb|CI730734.1|CI730734
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGNGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGC
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGG-GCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGC
EST: gi|88673215|gb|CI725990.1|CI725990
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88674941|gb|CI729054.1|CI729054
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|89171533|gb|CI720592.1|CI720592
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|89172286|gb|CI721345.1|CI721345
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|89172211|gb|CI721270.1|CI721270
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88673600|gb|CI727713.1|CI727713
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|89172537|gb|CI721596.1|CI721596
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88371640|gb|CI602818.1|CI602818
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88670860|gb|CI724976.1|CI724976
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88673645|gb|CI727758.1|CI727758
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88594127|gb|CI713298.1|CI713298
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88673583|gb|CI727696.1|CI727696
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88668130|gb|CI722869.1|CI722869
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88669458|gb|CI723376.1|CI723376
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88672219|gb|CI726335.1|CI726335
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88667358|gb|CI722097.1|CI722097
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88355873|gb|CI625502.1|CI625502
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88742870|gb|CI766378.1|CI766378
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88670918|gb|CI725034.1|CI725034
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88668728|gb|CI719685.1|CI719685
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88593664|gb|CI713618.1|CI713618
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCANCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGC
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCC-TATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGC
EST: gi|88595057|gb|CI715213.1|CI715213
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88905260|gb|CI712559.1|CI712559
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88349124|gb|CI678094.1|CI678094
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88666454|gb|CI718590.1|CI718590
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88406443|gb|CI598936.1|CI598936
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|86848662|gb|CI293965.1|CI293965
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88442752|gb|CI693758.1|CI693758
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88669258|gb|CI719396.1|CI719396
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88675630|gb|CI729743.1|CI729743
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88588287|gb|CI706094.1|CI706094
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88673355|gb|CI727395.1|CI727395
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88672924|gb|CI727039.1|CI727039
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GNCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88676134|gb|CI730247.1|CI730247
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88762905|gb|CI772461.1|CI772461
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88740582|gb|CI764090.1|CI764090
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88431441|gb|CI579558.1|CI579558
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|86830345|gb|CI290469.1|CI290469
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGG
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGG
EST: gi|88594779|gb|CI714737.1|CI714737
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88668250|gb|CI722989.1|CI722989
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACC-T                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|66920252|gb|CX107100.1|CX107100
EST:     TGATAT-CACCATGCCTACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: TGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|33688529|gb|CF316768.1|CF316768
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|33680394|gb|CF308633.1|CF308633
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88675849|gb|CI729421.1|CI729421
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88904644|gb|CI711943.1|CI711943
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|8857824|gb|AU095142.1|AU095142
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|87017445|gb|CI287985.1|CI287985
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88904485|gb|CI711793.1|CI711793
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88675513|gb|CI729626.1|CI729626
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|33672502|gb|CF300741.1|CF300741
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|33693589|gb|CF321828.1|CF321828
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88689779|gb|CI731357.1|CI731357
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88674562|gb|CI728675.1|CI728675
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAACCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88905317|gb|CI712616.1|CI712616
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGC
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCC-TATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGC
EST: gi|88851912|gb|CI679470.1|CI679470
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|33685055|gb|CF313294.1|CF313294
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|88677297|gb|CI729955.1|CI729955
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCT
EST: gi|33653782|gb|CF276396.1|CF276396
EST:     AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCT                         GGCGCATGCTATACACAGGGCC
genomic: AGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCC

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 74 (upstream exon), 69 (downstream exon)
Score: 23

TTGGGTTCTTGACAGAAGTCATGTTTCATGGTGGCAGGCCTTTGTCCCTCAGGGGCTCTCTCAAGGCGCTTGAAGCTGATATCCACCATGCCAACACCCTgtaagctcct ... ttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCTGTCTTACAGCTCCATGGCTCCAATCATCCTTAACCTCATCCAGTGGATG




<











<


<











 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

agttcgttcttggtgttcttgagtgatactaatagatgattctgtttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCTGTCTTACAGCTCCATGGCTCCAATCATCCTTAACCTCATCCAGTGGATG
                          tactaat  putative branch site (score: 23)
                                       ttctgtttgttttc  putative PPT
                         atactaata  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
atttctgattttgagtatttttttaaaaaaagaatttgtggggatagttcgttcttggtgttcttgagtgatactaatagatgattctgtttgttttcagGGCGCATGCTATACACAGGGCCTATGGGGGTGCCTGTGTGCAGATGAGGCTGTCTTACAGCTCCATGGCTCCAATCATCCTTAACCTCATCCAGTGGATG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  CAGCTC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGTGGA
- ttctgat
- - - - - - - - - - - - aaaaaaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gttcttg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tgatact
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gatgatt