1 5' 3' | 2 5' 3' |
gtattatatacagtatagcatgtagttattttatgtgcttcaatattgctcttccatctcttgtcggcatcatctgtataatgctattgttacattatatgttgtgtgcttcaatttaatttgtatctcaaattctttcagttggttttgtgctctttttatagctaaaactagcccatgtgtgtatgcagAGCACATATGGCGCTGGTGAAGATTGGGCAGTGGGGTGGAAATGGAGGGTCCGCTCAGGACATCAGTGTGCCACCCTGCAAACTCACTAGCGTGACTATT
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os01g25280.1 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CAACATTCAATTTAAGTGTGAG AGCACATATGGCGCTGGTGAAGATTGGGCAGTGGGGTGGAAATGGAGGGTC
genomic: CAACATTCAATTTAAGTGTGAGgtattatata ... gtgtatgcagAGCACATATGGCGCTGGTGAAGATTGGGCAGTGGGGTGGAAATGGAGGGTC
ttcagttggttttgtgctctttttatagctaaaactagcccatgtgtgtatgcagAGCACATATGGCGCTGGTGAAGATTGGGCAGTGGGGTGGAAATGGAGGGTCCGCTCAGGACATCAGTGTGCCACCCTGCAAACTCACTAGCGTGACTATT
agctaaa putative branch site (score: 8)
tttttatagctaaaa TA-rich tract