1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
...atttgttaatacaacacgtgttccatgaaatctgaagatgatgttgattatcatgaccactaaaattctgtaaatgatgttttcattgttaggaatccagGATGCCCCTATGAAATGCGTCCTTCACTGTGGAAATGGATCAGAGAAATATCACATTTTGCTCTTAACAGCTTCCCAGGAATATGCAATTCTTTTGGTTT
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os01g12810.3 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTCCTTGGCCAATGAACGCTCGTTGCTGCCAGTAGCTCGTTGATTCTCAG GATGCCCCTATGAAATGCGTCCTTCACTGTGGAAATGGATCAGAGAAATAT
genomic: CTCCTTGGCCAATGAACGCTCGTTGCTGCCAGTAGCTCGTTGATTCTCAGgtgaacgcgc ... aggaatccagGATGCCCCTATGAAATGCGTCCTTCACTGTGGAAATGGATCAGAGAAATAT
gattatcatgaccactaaaattctgtaaatgatgttttcattgttaggaatccagGATGCCCCTATGAAATGCGTCCTTCACTGTGGAAATGGATCAGAGAAATATCACATTTTGCTCTTAACAGCTTCCCAGGAATATGCAATTCTTTTGGTTT
cactaaa putative branch site (score: 2)
taaaattctgtaaat TA-rich tract