1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtaaacccaggaacttggacaatcccctcgaatgcaggatcaaatgtcttggggtttgcgtcgatctgattttgttgctcttcgccttggcttctccagCGGGTCTACGGCTTCGCCGCGTGCTTGGTTGCGGGACTGGCTCTGATGATCCTG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os01g11980.1 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATTCTATCCTTGGCGACACCGAGGGCATATGCTCCCTATCCCCTGTCCAG CGGGTCTACGGCTTCGCCGCGTGCTTGGTTGCGGGACTGGCTCTGATGATCEST: gi|88303244|gb|CI668892.1|CI668892
genomic: ATTCTATCCTTGGCGACACCGAGGGCATATGCTCCCTATCCCCTGTCCAGgtaaacccag ... gcttctccagCGGGTCTACGGCTTCGCCGCGTGCTTGGTTGCGGGACTGGCTCTGATGATC
EST: ATTCTATCCTTGGCGACACCGAGGGCATATGCTCCCTATCCCCTGTCCAG CGGGTCTACGGCTTCGCCGCGTGCTTGGTTGCGGGACTGGCTCTGATGATCEST: gi|33660828|gb|CF291795.1|CF291795
genomic: ATTCTATCCTTGGCGACACCGAGGGCATATGCTCCCTATCCCCTGTCCAGgtaaacccag ... gcttctccagCGGGTCTACGGCTTCGCCGCGTGCTTGGTTGCGGGACTGGCTCTGATGATC
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genomic: ATTCTATCCTTGGCGACACCGAGGGCATATGCTCCCTATCCCCTGTCCAGgtaaacccag ... gcttctccagCGGGTCTACGGCTTCGCCGCGTGCTTGGTTGCGGGACTGGCTCTGATGATC
tgtcttggggtttgcgtcgatctgattttgttgctcttcgccttggcttctccagCGGGTCTACGGCTTCGCCGCGTGCTTGGTTGCGGGACTGGCTCTGATGATCCTG
atctgat putative branch site (score: 2)
cttctcc putative PPT
attttgtt TA-rich tract