1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
...ttagccattattttaccattaattcaaagtagttttggtattaaaagatcagttatcaaatattttcttgaaattaaattttcatttttatttttaacagGTTAGGTTTGATGGTTGTTGGGGGCATAATATTGGCTTCTTTCATGACATATGCTTCCGAACATCTTGCTATCCGATCATTTCTCAAAGGCTTTGATGAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA19G43630.1 |
intron # | 9 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCAGCTCAATCGTTGCCTTGTCTTTTTGGAATTACTGCCTTGTTTTTAAA ATTAGGTTTGATGGTTGTTGGGGGCATAATATTGGCTTCTTTCATGACATAEST: gi|58015124|gb|CX701866.1|CX701866
genomic: GCAGCTCCATCGTTGCCTTGTCTTTTTGGAATTACTGCCTTGTTTTTAAGgtaatttatg ... tttttaacagGTTAGGTTTGATGGTTGTTGGGGGCATAATATTGGCTTCTTTCATGACATA
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genomic: GCAGCTCCATCGTTGCCTTGTCTTTTTGGAATTACTGCCTTGTTTTTAAGgtaatttatg ... tttttaacagGTTAGGTTTGATGGTTGTTGGGGGCATAATATTGGCTTCTTTCATGACATA
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genomic: GCAGCTCCATCGTTGCCTTGTCTTTTTGGAATTACTGCCTTGTTTTTAAGgtaatttatg ... tttttaacagGTTAGGTTTGATGGTTGTTGGGGGCATAATATTGGCTTCTTTCATGACATA
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EST: GCAGCTCCATCGTTGCCTTGTCTTTTTGGAATTACTGCCTTGTTTTTAAG GTTAGGTTTGATGGTTGTTGGGGGCATAATATTGGCTTCTTTCATGACATAEST: gi|254340000|gb|GR858125.1|GR858125
genomic: GCAGCTCCATCGTTGCCTTGTCTTTTTGGAATTACTGCCTTGTTTTTAAGgtaatttatg ... tttttaacagGTTAGGTTTGATGGTTGTTGGGGGCATAATATTGGCTTCTTTCATGACATA
EST: GCAGCTCCATCGTTGCCTTGTCTTTTTGGAATTACTGCCTTGTTTTTAAG GTTAGGTTTGATGGTTGTTGGGGGCATAATATTGGCTTCTTTCATGACATA
genomic: GCAGCTCCATCGTTGCCTTGTCTTTTTGGAATTACTGCCTTGTTTTTAAGgtaatttatg ... tttttaacagGTTAGGTTTGATGGTTGTTGGGGGCATAATATTGGCTTCTTTCATGACATA
agatcagttatcaaatattttcttgaaattaaattttcatttttatttttaacagGTTAGGTTTGATGGTTGTTGGGGGCATAATATTGGCTTCTTTCATGACATATGCTTCCGAACATCTTGCTATCCGATCATTTCTCAAAGGCTTTGATGAG
ttttcatttttatttt CT-rich tract
aaatattttcttgaaa TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ttagccattattttaccattaattcaaagtagttttggtattaaaagatcagttatcaaatattttcttgaaattaaattttcatttttatttttaacagGTTAGGTTTGATGGTTGTTGGGGGCATAATATTGGCTTCTTTCATGACATATGCTTCCGAACATCTTGCTATCCGATCATTTCTCAAAGGCTTTGATGAG
- agccatt
- - - - - - - -ccattaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aaattaaa