1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
...tttctctaattttctaatttagtttgctgtggcatgttagtttttttttaaatactaagagcaaagttttacttatttttgtgatgatgctgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTTCCACAGCTATTCTTCATAGAACACTGACCCCGTAGTTACCCAAGTGCC
species | Glycine max |
transcript | GLYMA19G42180.2 |
intron # | 9 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|208151602|gb|GD949085.1|GD949085
genomic: TTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|193409210|gb|FK373284.1|FK373284
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGCTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|207773841|gb|GD746225.1|GD746225
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCEST: gi|208261775|gb|GE059542.1|GE059542
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTC
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|208130655|gb|GD932894.1|GD932894
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTEST: gi|207716012|gb|GD699390.1|GD699390
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|208208341|gb|GE004720.1|GE004720
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|208321586|gb|GE120843.1|GE120843
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGNTTTGTTTTCAEST: gi|208258091|gb|GE051010.1|GE051010
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCA
EST: ATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTEST: gi|193531131|gb|FK486252.1|FK486252
genomic: ATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTT-GTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|208183401|gb|GD982841.1|GD982841
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAAEST: gi|193419751|gb|FK382379.1|FK382379
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAA
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCAEST: gi|207706968|gb|GD687152.1|GD687152
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCA
EST: GATGGACTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|208284510|gb|GE086402.1|GE086402
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGGTTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|193560266|gb|FK518929.1|FK518929
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGEST: gi|208319178|gb|GE115439.1|GE115439
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAG
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|207770602|gb|GD745814.1|GD745814
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|208169237|gb|GD972252.1|GD972252
genomic: GATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTEST: gi|207817925|gb|GD791888.1|GD791888
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|193412506|gb|FK379529.1|FK379529
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACAATGTTTCGGTAGGATTTGTTTEST: gi|207817956|gb|GD791905.1|GD791905
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACA-TGTTTCGGTAGGATTTGTTT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|193592847|gb|FK548753.1|FK548753
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|193398904|gb|FK362586.1|FK362586
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|208096992|gb|GD894673.1|GD894673
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTT-CTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTEST: gi|193680900|gb|FK622804.1|FK622804
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|193672758|gb|FK619814.1|FK619814
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGEST: gi|208166433|gb|GD963413.1|GD963413
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAG
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCEST: gi|208215306|gb|GE012419.1|GE012419
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTC
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|193455648|gb|FK418799.1|FK418799
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCCTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|193481534|gb|FK445561.1|FK445561
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|208233027|gb|GE032780.1|GE032780
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|208200139|gb|GD996040.1|GD996040
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|193362608|gb|FK325362.1|FK325362
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTC-TTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|193417868|gb|FK383406.1|FK383406
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGCTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|193435400|gb|FK402378.1|FK402378
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTEST: gi|193398086|gb|FK361208.1|FK361208
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|193712103|gb|FK643498.1|FK643498
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|193721520|gb|FK658676.1|FK658676
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGEST: gi|8669208|gb|BE190315.1|BE190315
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGG
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|207806217|gb|GD779254.1|GD779254
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATAGEST: gi|208151132|gb|GD948629.1|GD948629
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAAT-G
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|208339520|gb|GE138582.1|GE138582
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCAEST: gi|193589739|gb|FK544655.1|FK544655
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCA
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGCTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|193403094|gb|FK369040.1|FK369040
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: TGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|193486132|gb|FK452206.1|FK452206
genomic: TGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCCTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|207826859|gb|GD797422.1|GD797422
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|193687487|gb|FK629202.1|FK629202
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTTGTTTTCAEST: gi|207767749|gb|GD740721.1|GD740721
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTT-GTTTTCA
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|208048507|gb|GD847480.1|GD847480
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|193587554|gb|FK542589.1|FK542589
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|208236348|gb|GE032522.1|GE032522
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGEST: gi|207776351|gb|GD750344.1|GD750344
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATG
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGG-AGGATTTGTTTTEST: gi|193325611|gb|FK288445.1|FK288445
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTT-CTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTEST: gi|193405464|gb|FK372099.1|FK372099
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTT-CTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCAEST: gi|208166001|gb|GD959957.1|GD959957
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCA
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTEST: gi|7326402|gb|AW620211.1|AW620211
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|193403962|gb|FK367332.1|FK367332
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|207752499|gb|GD722657.1|GD722657
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|208186262|gb|GD987115.1|GD987115
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|207717307|gb|GD698166.1|GD698166
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|5510333|gb|AI856775.1|AI856775
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: CATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTEST: gi|208145563|gb|GD942698.1|GD942698
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTEST: gi|208313890|gb|GE114276.1|GE114276
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTT
EST: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAAT GTCACATGTTTCG
genomic: GATGGATTCTAGTTCCTCTTTTGTGGATACGTTTCTTGTTTCTTGTCAATgtaagtgcat ... tgcctttcagGTCACATGTTTCG
ttttaaatactaagagcaaagttttacttatttttgtgatgatgctgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTTCCACAGCTATTCTTCATAGAACACTGACCCCGTAGTTACCCAAGTGCC
ctgcctttc CT-rich tract
aaagttttacttattt TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| tttctctaattttctaatttagtttgctgtggcatgttagtttttttttaaatactaagagcaaagttttacttatttttgtgatgatgctgcctttcagGTCACATGTTTCGGTAGGATTTGTTTTCATGGTCTACGGGTCCAGAAATGTTCCACAGCTATTCTTCATAGAACACTGACCCCGTAGTTACCCAAGTGCC
- - - - - - - - - - - -ttgctgt
- - - - - - - - - - - - - - - -gcatgtt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gatgatg