Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...acgtgtttaatgggaagaagagtttcctattgtaatagctgcaaatgtttggagctcccagtatgttgcatgccaatgccttatttttttgtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAAGCCAAGTATTGAGAGGGAGCCTGCGTTCAATGAGGTCAGATAACTTACA

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G35830.5
intron # 9
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|208111486|gb|GD909204.1|GD909204
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193719882|gb|FK653878.1|FK653878
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGGGAGCTAAATTTTT
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGC-AAATTTT-
EST: gi|193437204|gb|FK400425.1|FK400425
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208094106|gb|GD891535.1|GD891535
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTNTTTTTAG-ATGTTGAGAGCAAAATTTT
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAA-TTTT
EST: gi|193725550|gb|FK661944.1|FK661944
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGTCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGTAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193704853|gb|FK644819.1|FK644819
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|207762945|gb|GD733876.1|GD733876
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCNTNTCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193499467|gb|FK461262.1|FK461262
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208308433|gb|GE109693.1|GE109693
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193527310|gb|FK487566.1|FK487566
EST:     CATTTCCTAAGACAGAAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: CATTTCCTAAGACAGA-GTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208274393|gb|GE070125.1|GE070125
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTG
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTG
EST: gi|193379005|gb|FK344339.1|FK344339
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTT
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTT
EST: gi|193533179|gb|FK493699.1|FK493699
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAG-ATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208140735|gb|GD935189.1|GD935189
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGC
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGC
EST: gi|208328426|gb|GE127540.1|GE127540
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208058290|gb|GD856837.1|GD856837
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTT-AGTATGTTGAGAGCAAAT
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAAT
EST: gi|208174444|gb|GD971723.1|GD971723
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTT-AGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193378057|gb|FK344580.1|FK344580
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208195028|gb|GD992133.1|GD992133
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAG-ATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193638644|gb|FK586354.1|FK586354
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208192433|gb|GD994117.1|GD994117
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTTCTTTTTAAGTATGTTGAGAGCAAATTTT
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCT-CTTTTTA-GTATGTTGAGAGCAAATTTT
EST: gi|193554077|gb|FK512562.1|FK512562
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAG-ATGTTGGGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193433055|gb|FK395735.1|FK395735
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193440782|gb|FK405571.1|FK405571
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208260520|gb|GE058100.1|GE058100
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193422211|gb|FK389670.1|FK389670
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208093311|gb|GD893554.1|GD893554
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGNGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|192300499|gb|FG988856.1|FG988856
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCA-TTTATCGCATATCTTTTGCAA-C                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTT
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTT
EST: gi|193720715|gb|FK657815.1|FK657815
EST:     CATTTCCTAAGACAGAAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTAGGAAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTT
genomic: CATTTCCTAAGACAGA-GTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTT-GGA-GAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTT
EST: gi|151412195|gb|EV282007.1|EV282007
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGC-TCTTTT-AGTATGTTGAGAGCAAAT
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAAT
EST: gi|193667829|gb|FK613077.1|FK613077
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGGGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193575307|gb|FK529424.1|FK529424
EST:     AGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: AGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193351506|gb|FK317964.1|FK317964
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208070391|gb|GD870928.1|GD870928
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208111804|gb|GD913302.1|GD913302
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|207713495|gb|GD696178.1|GD696178
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTT--AGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208225269|gb|GE024946.1|GE024946
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193632721|gb|FK580569.1|FK580569
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208075437|gb|GD874282.1|GD874282
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAAGAATAGACTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATT
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGA-GA-T-G-CTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATT
EST: gi|193546231|gb|FK503192.1|FK503192
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAG-ATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208114546|gb|GD912157.1|GD912157
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAG-ATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193556536|gb|FK515189.1|FK515189
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|207749796|gb|GD718582.1|GD718582
EST:     ATTTACCTAAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: ATTT-CCT-AAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193548063|gb|FK505232.1|FK505232
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193722090|gb|FK657076.1|FK657076
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208213216|gb|GE012359.1|GE012359
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCGATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208281448|gb|GE073736.1|GE073736
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTT-AGTATGTTGAGAGCAAATTTTA
EST: gi|207753992|gb|GD723786.1|GD723786
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATT
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATT
EST: gi|208166752|gb|GD960386.1|GD960386
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTAT
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTAT
EST: gi|208337371|gb|GE133115.1|GE133115
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208307359|gb|GE108829.1|GE108829
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTT-AGTATGTTGAGAGCAAATTTTA
EST: gi|207755348|gb|GD729383.1|GD729383
EST:     GCATTTCCTAAGACGGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208220567|gb|GE017143.1|GE017143
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208077330|gb|GD876079.1|GD876079
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193360362|gb|FK325132.1|FK325132
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTT-GCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193331998|gb|FK301970.1|FK301970
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCACATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|207837150|gb|GD808459.1|GD808459
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193669876|gb|FK609844.1|FK609844
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCTTATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208207455|gb|GE004996.1|GE004996
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAAATTTTA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAA-TTTTA
EST: gi|193344041|gb|FK311955.1|FK311955
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTCTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193570310|gb|FK524905.1|FK524905
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193490641|gb|FK457726.1|FK457726
EST:     CATTTCCTAAGAACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATG
genomic: CATTTCCTAAGA-CAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATG
EST: gi|208183886|gb|GD985762.1|GD985762
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193435557|gb|FK400729.1|FK400729
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193377816|gb|FK341480.1|FK341480
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|207842322|gb|GD814608.1|GD814608
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208154985|gb|GD954918.1|GD954918
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193565688|gb|FK523197.1|FK523197
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGGGANCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208163815|gb|GD963287.1|GD963287
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208154866|gb|GD957613.1|GD957613
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193649674|gb|FK596237.1|FK596237
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193728975|gb|FK663851.1|FK663851
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCTAAATTTT
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCT-CTTTTTAGTATGTTGAGAGC-AAATTTT
EST: gi|193499907|gb|FK464264.1|FK464264
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|207701427|gb|GD684016.1|GD684016
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGA
EST: gi|208054736|gb|GD850653.1|GD850653
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGGTGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208071973|gb|GD871473.1|GD871473
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAAGTATGTTGAGAGCAAATTTTA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTA-GTATGTTGAGAGCAAATTTTA
EST: gi|193725721|gb|FK660113.1|FK660113
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|207717530|gb|GD699116.1|GD699116
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGTCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|208090885|gb|GD888300.1|GD888300
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193490548|gb|FK453391.1|FK453391
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193400280|gb|FK367907.1|FK367907
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193464857|gb|FK430139.1|FK430139
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTTATGTTGAGAGCAAATTTTA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGT-ATGTTGAGAGCAAATTTTA
EST: gi|207841238|gb|GD810675.1|GD810675
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAAT
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAAT
EST: gi|193426431|gb|FK386588.1|FK386588
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|207827937|gb|GD798752.1|GD798752
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTT-AGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
EST: gi|193363916|gb|FK331696.1|FK331696
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAAGAGCAAATTTTA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGA-GAGCAAATTTTA
EST: gi|208213160|gb|GE012345.1|GE012345
EST:     GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAAC                         GTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA
genomic: GCATTTCCTAAGACAGAGTTGATGCAATTTATCGCATATCTTTTGCAAACgtaagtttgt ... gtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAA


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tgtttggagctcccagtatgttgcatgccaatgccttatttttttgtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAAGCCAAGTATTGAGAGGGAGCCTGCGTTCAATGAGGTCAGATAACTTACA
                                 ccttatttttttgtc  CT-rich tract
                                   ttatttttttgtcat  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
acgtgtttaatgggaagaagagtttcctattgtaatagctgcaaatgtttggagctcccagtatgttgcatgccaatgccttatttttttgtcatgccagGTTGGAGAGAGATGCTTTGCCTCTTTTTAGTATGTTGAGAGCAAATTTTAAGCCAAGTATTGAGAGGGAGCCTGCGTTCAATGAGGTCAGATAACTTACA

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GAGAGG