1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
gttagtccccttttctttaaaaacctcagtgattcctgttgcatggttcttaaattgagtttgatcatattatattgtgtcagATGTGCTTTAATGCATTTGATAAAGCCGCCGACCTTGATGTCTTGGACCATCCCATTCTGAATTTTATATATTACCTG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA05G26630.1 |
intron # | 9 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCTATGTGACTACCATATGCTTTTCATGCTTCCTTATCAGATGTGTTATG ATGTGCTTTAATGCATTTGATAAAGCCGCCGACCTTGATGTCTTGGACCATEST: gi|193718027|gb|FK653803.1|FK653803
genomic: GCTATGTGACTACCATATGCTTTTCATGCTTCCTTATCAGATGTGTTATGgttagtcccc ... attgtgtcagATGTGCTTTAATGCATTTGATAAAGCCGCCGACCTTGATGTCTTGGACCAT
EST: GCTATGTGACTACCATATGCTTTTCATGCTTCCTTATCAGATGTGTTATG ATGTGCTTTAATGCATTTGATAAAGCCGCCGACCTTGATGTCTTGGACCATEST: gi|151402287|gb|EV272100.1|EV272100
genomic: GCTATGTGACTACCATATGCTTTTCATGCTTCCTTATCAGATGTGTTATGgttagtcccc ... attgtgtcagATGTGCTTTAATGCATTTGATAAAGCCGCCGACCTTGATGTCTTGGACCAT
EST: GCTATGTGACTACCATATGCTTTTCATGCTTCCTTATCAGATGTGTTATG ATGTGCTTTAATGCATTTGATAAAGCCGCCGACCTTGATGTCTTGGACCATEST: gi|151407580|gb|EV277395.1|EV277395
genomic: GCTATGTGACTACCATATGCTTTTCATGCTTCCTTATCAGATGTGTTATGgttagtcccc ... attgtgtcagATGTGCTTTAATGCATTTGATAAAGCCGCCGACCTTGATGTCTTGGACCAT
EST: GCTATGTGACTACCATATGCTTTTCATGCTTCCTTATCAGATGTGTTATG ATGTGCTTTAATGCATTTGATAAAGCCGCCGACCTTGATGTCTTGGACCATEST: gi|4396554|gb|AI495551.1|AI495551
genomic: GCTATGTGACTACCATATGCTTTTCATGCTTCCTTATCAGATGTGTTATGgttagtcccc ... attgtgtcagATGTGCTTTAATGCATTTGATAAAGCCGCCGACCTTGATGTCTTGGACCAT
EST: TCATGCTTCCTTATCAGATGTGTTATG ATGTGCTTTAATGCATNTGATAAAGCCGCCGACCTTGATGTCTTGGACCATEST: gi|209706564|gb|BW676112.1|BW676112
genomic: TCATGCTTCCTTATCAGATGTGTTATGgttagtcccc ... attgtgtcagATGTGCTTTAATGCATTTGATAAAGCCGCCGACCTTGATGTCTTGGACCAT
EST: ACTACCATATGCTTTTCATGCTTCCTTATCAGATGTGTTATG ATGTGCTTTAATGCATTTGATAAAGCCGCCGACCTTGATGTCTTGGACCATEST: gi|254327808|gb|GR834773.1|GR834773
genomic: ACTACCATATGCTTTTCATGCTTCCTTATCAGATGTGTTATGgttagtcccc ... attgtgtcagATGTGCTTTAATGCATTTGATAAAGCCGCCGACCTTGATGTCTTGGACCAT
EST: GCTATGTGACTACCATATGCTTTTCATGCTTCCTTATCAGATGTGTTATG ATGTGCTTTAATGCATTTGATAAAGCCGCCGACCTTGATGTCTTGGACCAT
genomic: GCTATGTGACTACCATATGCTTTTCATGCTTCCTTATCAGATGTGTTATGgttagtcccc ... attgtgtcagATGTGCTTTAATGCATTTGATAAAGCCGCCGACCTTGATGTCTTGGACCAT
gtgattcctgttgcatggttcttaaattgagtttgatcatattatattgtgtcagATGTGCTTTAATGCATTTGATAAAGCCGCCGACCTTGATGTCTTGGACCATCCCATTCTGAATTTTATATATTACCTG
gtttgat putative branch site (score: 5)
ttaaattgagtttgat TA-rich tract